如何处理甲减和亚临床，应根据病人具体情况决定。
如亚临床甲减患者，通常无症状，也无体征，常因查体后被人发现，因此，绝大部分亚临床甲减无需处理。对于甲减症患者来说，可以选择药物进行辅助治疗，比如使用左甲腺素钠或者右甲素，这都能够取得较好疗效。但若伴有较严重的甲减症状如乏力、便秘等，且Tsh大于10毫国际单位每升，病人再次合并动脉硬化，血脂异常和甲状腺相关抗体升高的问题，需要处理。因此，亚临床甲减和甲减都应该进行治疗，而不能简单地把二者对立起来。
严重，甲状腺功能减退是属于慢性的疾病，一般需要长期的药物治疗来控制病情的稳定，需要定期复查血甲状腺功能的指标，根据指标来调整药物的剂量。一般每月都是需要复查一次。如果长时间不复查，那会有引起血甲状腺功能指标波动的改变。
甲减不严重，但是需要用甲状腺制剂终身替代治疗。甲状腺功能减退症简称甲减，是由于甲状腺激素合成分泌减少或其生理效应不足所致机体代谢降低的一种疾病。主要症状有面色苍白表情淡漠毛发脱落体重增加记忆力减退反应迟钝，共济失调，心动过缓，心输出量减少，血压降低，厌食，腹胀，便秘等。
一般情况下，轻微甲减可通过日常护理、使用药物等措施进行治疗，具体内容如下：
甲减的治疗方法是以甲状腺激素代替疗法为主，优甲乐和甲状腺激素篇是比较常见的药物。首先是低剂量，然后是通过全身的表现和化验的结果，逐步增加，直至所有的病症都没有了，t3、t4、ft3、tsh都会回复到原来的水平。从那以后可能也需继续服用，避免随意中断，不然1-3个可能就会有复发的情况。日常生活中要多吃些低脂肪食物，多补充碘。
甲减会影响怀孕，因为甲减造成不孕不育，造成流产，死产。即使怀孕了之后，甲状腺功能对于后代的神经系统的发育也是有明确的影响，所以育龄期的女性在备孕期间就能够检查甲状腺功能，尽早的发现甲减疾病，避免已经怀孕了因为甲减造成流产或者不得不中途来终止妊娠。
