做卵巢囊肿手术需要错开月经期，尽量远离经期，以免术后出现月经后出现盆腔充血，从而影响到卵巢切口的愈合。
如果卵巢囊肿是良性的，可以通过腹腔镜进行微创手术，在腹部开3-4个小洞，每一个小洞1-2cm，然后将囊肿切除。手术一般需要一个小时，不会对人体造成太大的伤害，而且恢复的很快，术后需要对切除的组织进行病理检查，确定为良性就能治疗。如果发现病理为恶性，则要进一步做进一步的手术，同时还要进行放疗、化疗等辅助治疗。术后1个月要注意多休息，避免剧烈的运动，多吃富含蛋白质的食物，可以增强体质，加快伤口的愈合。
卵巢切除手术，这应该是可以治疗好的，手术是彻底治疗卵巢囊肿的方法，药物治疗一般只有控制才能彻底治疗。大多数人不会复发，当然也有少数人会复发，所以术后定期检查，注意休息，保持好心情。
女性体内激素水平紊乱，或者妇科炎症都可能造成卵巢囊肿.
首先需要知道所患的卵巢囊肿是生理性卵巢囊肿，还是病理性卵巢囊肿。生理性卵巢囊肿是由于在排卵期后，由黄体期所形成的囊肿，一般是小于5厘米。在黄体期结束之后，激素水平下降，就会自动消失的，并不需特殊处理。而由于炎症导致，以及内分泌紊乱或者遗传因素所导致，还有子宫内膜异位症所导致的卵巢巧克力囊肿等，就需要根据病情来进行治疗。
卵巢囊肿都是生理性的改变，对于直径比较小的囊肿，多数可以逐渐消退，如果是囊肿越来越小，然后消退，就不需要再次治疗，囊肿一直在并且长大，需要进行手术治疗，避免过度劳累，不能长时间不睡觉。
如果是良性卵巢囊肿可以采用切除术，如果卵巢囊肿已经是晚期时，为了避免囊肿组织向盆腔和腹腔转移，要尽快的切除原发囊肿。但是，晚期的囊肿已经与卵巢粘黏到一起，并紧贴着盆覆膜，所以需要将整个卵巢全部切除。
