唇腭裂是母亲在生长发育过程中一些不利因素造成的。这些因素可归纳为遗传因素和环境因素两大类，临床实践中经常发现唇腭裂患儿，在其直系或旁系亲属中，也有类似的畸形，这是由于某个基因的突变造成的。环境因素指的是胚胎生长发育的环境。母体是胚胎生长发育的温床，如果母体受到外界的干扰，就会影响胚胎发育。
怀孕的男女双方不抽烟不喝酒不吸毒，是最主要预防唇腭裂的方法。特别怀孕前三个月病毒感染或者是接触放射性的物质或者是乱用药物，孕妇在怀孕之后一定要注意自己的营养问题，多吃一些高蛋白优质蛋白的食物。
引起唇腭裂的原因当属遗传因素，唇腭裂患者其直系亲属或旁系亲属中有类似畸形发生。同时环境因素也是引起先天性唇腭裂的原因，营养因素：营养因素也是一种比较严重的原因，很多孕妇在怀孕期间会出现呕吐的情况，之后会有不同程度厌食的情况，这时胎儿摄入的营养是不足的，所以造成维生素缺乏，在动物实验中，用缺乏维生素A、E的食物喂养怀孕小白鼠时，出生的幼鼠常有唇腭裂发生。
唇腭裂有以下表现：首先，会出现嘴唇开裂和上颌开裂；甚至牙龈都裂开了。如果病人病得很重，它会影响病人吃牛奶并导致营养不良。儿童在成长和发展过程中不能说清楚。孩子会有自卑心理，导致心理障碍。基于此，如果儿童患有唇腭裂。
唇腭裂的原因主要是各种因素导致的孕妇维生素缺乏都会引起胎儿唇腭裂的发生，另外在怀孕期间孕妇如果内分泌紊乱以及药物因素都会导致胎儿畸形，或是频繁接触x线或微波等都会导致宝宝出现唇腭裂。