一般情况下，治疗肝内钙化灶疾病的方式有以下几种。
1、药物治疗：如果肝内钙化灶患者，出现腹痛、发热、肝区疼痛等症状，应及时到医院就医，并在医生的指导下服用双氯芬酸、阿莫西林等药物进行治疗。
2、手术治疗：如果肝内钙化灶是因结石、肿瘤等原因引起，可能需要通过结石手术、或是肿瘤切除术来进行治疗。
建议患者及时到医院就医，不要拖延病情，以防诱发其他疾病。
肝内钙化灶在肝脏影像学改变中较为常见，亦为较常见肝脏病变之一，通常不是肝炎。
在肝内外胆管系统中发生的结石或狭窄都可以形成肝内钙化灶，但并没有明确区分两者。肝内钙化灶稳定，多数提示过去对肝脏有损害，或具有某些特殊肝脏疾病史。如果在临床上出现了肝功能损害或其他肝实质变化时，都应考虑到肝内钙化病灶的存在，因为这些情况可以导致诊断错误。肝内钙化灶通常无需特别治疗，亦非肝炎之表现。
肝内钙化灶和肝内胆管结石的区别是肝内钙化灶是指肝脏组织或者是细胞里面的钙化表现，肝内胆管结石说明是肝内胆管里面长了结石。肝内胆管结石会出现远端的胆管出现扩张，肝内钙化灶不存在这样的现象。
肝内钙化灶不一定是由肝炎引起。
肝内钙化灶并非一定是肝炎的结果，肝内钙化灶多为曾有局部受破坏而留下的钙化病灶，可由肝炎所致，亦可并非肝炎所致。肝硬化患者由于肝脏本身结构上的改变和代谢功能受损等原因会出现肝内钙化灶。有不少患者在检查时，发现有肝内钙化灶的，但无各种类型的肝炎，一般无需特殊治疗。若需判定有无肝炎，首先要检查肝功能，乙肝两对半和丙肝病毒抗体，如发现有大三阳，小三阳或者小二阳，不管有无肝内钙化灶，均需注意，应重视定期复查和对疾病的评价，培养良好的生活习惯，如符合治疗标准，应主动进行正规治疗。
肝脏的钙化是指肝脏中的某种疾病已经稳定和恢复后的一种病理学变化。由于病灶数量很少，对人体没有任何不良的作用，所以要排除肝内胆管结石等肝内病变，如果确诊为肝内钙化灶，则无需进行治疗的，定期复查即可。
但是，如果确诊为肝内胆管结石，而不是肝内肝化灶，则要进行治疗，尤其是单纯的肝内肝化灶，在处理肝胆管结石的时候，要进行病变的手术。要区别于肝内胆道，以防止误诊。肝内钙化灶不能自行消除，需要明确的是哪些因素引起的，以及引起这种病变的原因，找到病因，及时进行处理。钙化病病史并不需要进行手术，只要病情稳定，就能治愈。
肝内胆管钙化进一步可形成胆管内淤积性泥沙结石，经B超检查一般都能明确诊断。常见病因为慢性胃肠道反流性炎症导致的胆管炎症及胆囊摘除术后、胆管手术、肝叶切除术后、肝脏内外胆管发生扭曲、变形等导致胆汁淤积形成泥沙结石，都可以造成肝内胆管结石形成。
