病毒性脑膜炎经过正规治疗，大部分人可以恢复正常，少部分留有后遗症。运动方面的落后或不协调。智力方面有不同程度的反应迟钝。另外大脑皮层神经原的异常放电。癫痫。要好转应给以抗病毒治疗。营养脑细胞的药物。吸氧。多吃新鲜水果和蔬菜，补充各种微量元素。
后遗症的治疗大部分不需要用太多的药，可以通过运动，比如脑炎后遗症病人可以参加适量运动，如散步、慢跑、羽毛球、网球、乒乓球等运动，若病情稳定，还可以打篮球、踢足球等，适当的体育活动可以增加神经细胞的稳定性。但不要过于激烈，还要忌过饥或过饱，勿暴饮暴食。过度饥饿使血糖水平降低，而低血糖往往诱发脑炎后遗症发作。来慢慢恢复治疗。
应该及时的到正规的专科医院进行科学的治疗脑炎后遗症的饮食对于病人来说不仅能够补充身体缺失的营养而且对于辅助脑炎后遗症病人治疗更具有不错的康复作用。补充卵磷脂。卵磷脂能增强脑部活力延续脑细胞老化并且有护肝、降血脂、预防脑卒中等作用。蛋黄豆制品等含有丰富的卵磷脂不妨适量进食。
有病毒性脑膜炎的严重后遗症失语、吞咽困难，癫痫等神经系统的损害，注意力不集中、健忘，兴奋不安、记忆力减退，表情淡漠，智力低下，多汗、流涎等。对于病毒性脑炎留下的后遗症，需积极的康复治疗。
疾病发现早、病情较轻者，预后较好，不遗留任何后遗症，恢复后与正常人无异；病毒毒力强、治疗不及时者，可出现严重后遗症，甚至威胁生命；病毒侵蚀颅脑部位的不同，后遗症状也不同，常表现为失语、肢体功能缺损、瘫痪、智能障碍、痴呆等。
大多数病毒性脑膜炎可以治，没有后遗症。病毒性脑膜炎是指病毒侵入软脑膜，症状相对较轻，临床表现与普通感冒相似。可能有发烧、头痛、恶心、疲劳、颈部僵硬等症状。有些不用治疗就能康复，一般不会留下后遗症。临床诊断不能仅凭的身体体征来判断。可能有轻微的症状，但是脑实质中已经出现了病变，可能会有后遗症。
