基底动脉血流速度增快，主要是脑功能不全的反映，可能患者出现了供血不足或者血管狭窄的情况。脑功能不全主要是脑功能受损导致的，主要与脑动脉硬化有关，如比较常见的颈椎病，对椎动脉进行刺激。
基底动脉血流速度减慢，其实就是后循环缺血，不是很严重。但是如果基底动脉的血流速度减慢到一定程度，影响脑干的供血，病人有可能会出现比较严重的症状，表现为头晕，发作性的视物旋转，恶心，呕吐，严重的时候可以出现短暂的神经功能缺损症状，比如肢体的麻木无力等症状。对于基底动脉的血流速度减慢，考虑是由于动脉硬化，血管弹性差，血液成分的堆积或者血管内壁的斑块形成，导致这种血流速度减慢，可以服用改善循环的药物。
如果是高血压，糖尿病，高脂血症，动脉硬化以及血管炎症导致椎基底动脉系统的血管管腔狭窄，血栓形成引起的椎-基底动脉血流速度减慢，需要进行针对各种危险因素进行治疗，如降压，降糖，降脂；颈椎病导致颈椎横突孔狭窄，压迫椎动脉，需要治疗颈椎病。
双椎基底动脉血流速度减慢是因为椎动脉粥样硬化，基底动脉血流速度减慢会引起脑供血不足，常规出现经常头晕恶心肢体麻木，要做到生活方式的改变，包括戒烟，加强锻炼，控制体重，低盐低脂饮食等。
两侧椎动脉收缩期血流速增高考虑是由于动脉硬化，狭窄引起可以导致脑供血不足出现头痛，头晕等症状。比较常见，可以通过口服药物治疗缓解症状，右侧椎动脉基底动脉流速偏高，说明血管有狭窄，脑供血不足。
由于小脑及脑干依靠椎-基底动脉的供血，当椎-基动脉供血不足时常出现眩晕等症状。其病因多为颈椎病、脑动脉粥样硬化、低血压、脑动脉炎、颈部大血管扭曲、心脏病、血管畸形、血高凝状态、锁骨下动脉盗血综合征等。出现眩晕、恶心呕吐、步态不稳，或视力模糊、复视、单眼及双眼同侧视野缺损，或语言不利、昏厥或跌倒、面部及四肢麻木，感觉异常等。
