如果是肝脏的囊肿比较小，不需要特别的治疗，可以定时进行检查。但若囊肿大且有挤压感，应立即进行囊肿开窗手术。如有炎症、囊液中有胆汁，应在开窗手术后进行导管引流。若有多囊肝脏的征象，应尽早进行肝脏移植。在日常生活中要注意保持情绪的放松，不要过于紧张和焦躁。另外还要注意多做一些运动，比如慢跑、游泳等，有助于改善症状。
右肝囊肿的治疗在5cm以上，而且对其他脏器有压迫或者出现肝脏功能改变时，需要在超声引导下经皮穿刺将囊液抽出后，再进行药物注射，来治疗肝囊肿，肝右叶囊肿的治疗也是这样进行的。一般需要看囊肿的大小，生长的部位，以及有没有其他并发症来决定。如果肝囊肿比较小，不需要进行干预治疗，需要定期进行复查。
直接挂内科，肝腹水治疗选择细胞靶向修复治疗比较有效，细胞靶向修复疗法就是利用物理或者是化学方法将血液内的有效成分进行分离、提纯、浓缩而制作成各种血液制剂，然后根据病人所患疾病的需要分别输给各自需要的病人，以代替输注全血。
肺囊肿治疗上可以先采用消炎、止痛类的西药治疗，或是采用些消炎、清热解毒类的中草药治疗。平常要求以清淡饮食为主，戒烟酒等。如果不忌嘴，有可能会导致肝功损害等。这种病通常不会有遗传性。
西医主要用药物治疗腹水，低蛋白补充白蛋白。如果这两种方法不可用，则只需要抽水。中药治疗腹水，是一项综合治疗方案，是肝脏保护和抗纤维化及腹水，腹水主要是通过大便排出的形式。对于腹水严重、胃部不好的，应使用中药。
