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以消除病因、增强体质、对症治疗为主。治疗方法应该坚持全身治疗和局部治疗相结合，中西医治疗相结合，生理和心理治疗相结合，对症治疗。口服维生素B、C和增进机体的抵抗力，有助于溃疡的愈合。
口腔溃疡的治疗以消除病因、增强体质、对症治疗为主，治疗方法应坚持全身治疗和局部治疗相结合，中西医治疗相结合，生理和心理治疗相结合。口腔溃疡常呈周期性发作，复发时间长短与口腔溃疡病史长短有密切关系。
药物治疗：配合中西类止疼消炎的药物来进行治疗。免疫力治疗：由于该病原因复杂，如果由免疫力降低引起，想缓解病情还得提高自身免疫力，必要多补充维生素，来补充流失掉的微量元素。
疱疹性口腔溃疡，前期患者可能会有发热，头疼，疲乏不适，全身肌肉疼痛，咽喉肿痛等急性的症状。
患者的颈部淋巴结可能会肿大，有触痛，口腔黏膜广泛充血，水肿，进入水疱期。口腔里会有成簇的小水疱形成，水疱破溃后形成溃疡，疼痛比较明显，溃疡会逐渐愈合，。
整个病程大概要7-10天左右，建议患者及时到口腔黏膜科就诊做治疗。
口腔溃疡治疗原则是消除致病诱因，增进机体健康，减轻局部症状，促进溃疡愈合，但是目前还没有特效药物，所以治疗时应针对每个病例的致病诱因和对药物的反应，有侧重地采用治疗方法和药物。平常注意休息，避免进食酸辣刺激食物，以减少复发次数。
反复口腔溃疡其实是复发性的阿弗他溃疡，也是口腔内最常见的口腔黏膜病。是由于免疫因素所引起的，例如自身免疫力比较差或者是有重大疾病者，有可能有放化疗或者是有糖尿病或者是有更年期综合症，这时都有可能会出现溃疡反复的现象。
