女性变男性手术主要为性器官再造，需制造正常的男性生殖器。该手术多利用人体的其他部位皮肤、软组织及软骨，如取前臂皮瓣，进行阴茎再造，手术效果理想，外形和血运状态维持较持久。此外，女性需进行乳腺的切除。国外进行男性变女性手术时较为彻底，多将性腺摘除，并口服激素维持人体正常状态，还需进行喉结再造等。
目前最常见的是玻璃体腔内注入康柏西普、雷珠单抗、激光外科、光动力疗法等，都能起到很好的作用。
早期及时进行外科治疗，可以取得更好的疗效，但若错过了最好的治疗时间，在病情较重的情况下进行手术，则会有更好的效果。因此，在眼眶周围的病变中，及早的诊断和治疗是至关重要的，尤其是黄斑退行性病变，是一种很普遍很严重的眼部病变，经常会引起视力的严重衰退，并且会引起颜色的不正常，甚至会出现看物的扭曲等症状，需要及时到正规的医疗机构进行检查，让医生明确病因和严重性。
变性手术是疼的，步骤是切除大部分的阴茎和睾丸，保留阴茎头和阴茎背神经，修剪阴茎头做成阴蒂，阴囊缩小后做成大阴唇，前尿道的一部分被改成小阴唇和阴道前庭，残留的包皮则返折到体内，人造出一个阴道，末端固定在骨盆。
女变男的手术，就要把女性的子宫和乳房等做一系列的手术。做这样的手术都要持续几年的时间才能够完成。做变性手术的朋友，就建议要有良好的心态。同时注意不要吸烟，不要喝酒，不要吃辛辣刺激的食品。
还是有一定的危险的，肝豆状核变性病人是不能通过婚检的，在婚检过程中重大遗传疾病是不允许生子的，肝豆状核变性病人的遗传性是通过血缘遗传的家族性疾病，因此，肝豆状核变性病人还是不要生育孩子，同时到医院做详细的检查。
一开始会感觉很不适应。刚刚做完男变女的变性手术后，自然会感觉尿道往体内凹进去而那里不适应的，概过几个月就习惯了。加入了女生的行列也很享受女生的生活方式，心态上改变了不少。
