胸腺瘤可以采用胸腔镜下微创手术，根据胸部CT的检查，判断胸腺瘤偏向于哪一侧胸腔。如果胸腺瘤偏向于左侧，就左侧开口进行胸腺瘤的摘除。如果胸腺瘤偏右侧，从右侧胸腔镜下胸腺瘤摘除术。
胸腺瘤手术后最常见后遗症为重症肌无力，重症肌无力和胸腺瘤有直接关系，如眼睑下垂或出现疲劳，上肢伸举费力、咀嚼吞咽困难等。还会造成肾病综合征肾炎的出现。
胸腺瘤不手术长大到一定体积就会压迫周围组织和器官出现胸痛，胸闷，气急，咳嗽，明显肿块，心包积液心慌气短等症状，还有出现并发症如重症肌无力，巨食管症，低蛋白血症，再障性贫血等。
胸腺瘤微创手术费用包含麻醉费用、手术费用以及术中所使用的一次性耗材等费用，包括超声刀等，总体费用大概在1到2万块钱左右。手术是胸腺瘤的主要治疗手段，尽管有时手术完全切除后仍有复发，手术后局部复发的治疗最好的办法仍然是手术。
胸腺瘤的治疗原则是一经诊断即应外科手术切除。无论良性或恶性胸腺瘤都应尽早切除。切除的恶性胸腺瘤可根据病理指导术后治疗，部分切除者术后放射治疗可缓解症状，延长存活时间。
