肾结石输尿管末端结石要用药物保守治疗。要用一些排石的药物多喝水，多运动，可以跳绳，能够促进结石的排出。出现血尿情况应该用点抗炎药物治疗，避免引起感染。输尿管结石一般会引起小腹和腰部的疼痛;结石移动时会产生剧痛，小的结石可通过药物排除。
肝脏内的胆管结石，可以先尝试药物治疗。如果是胆总管结石，那么还是需要手术治疗，或者是取石。注意个人的饮食习惯，避免油腻高脂肪的食物，暴饮暴食，三餐尽量的规律。
结石疼的时候可以肛门内给药，最常见的就是双氯灭痛栓50mg纳肛，一般3-5分钟就可以缓解疼痛。也可以肌肉注射止疼药物，比如强痛定、杜冷丁、654-2、黄体酮等，也可以静脉滴注间苯三酚、654-2。
根据病情选择支气管镜下取石，或者是手术切除的方法。对于不伴有肺实质损伤的，可以首选支气管镜下取石，微创的并发症较小。对于反复出现肺部感染，以及反复大量咯血以及肺脓肿的，可以选择手术切除的方法。
肝胆管结石可引起腹痛和全身皮肤粘膜发黄，从而引起梗阻性黄疸。应该尽早手术治疗。肝胆管结石比单纯胆石治疗相对更难治疗。因此尽早进行肝胆外科手术进行对症治疗。应根据个人情况选择合适的手术，尽早清除结石，避免并发症。
肝内胆管结石是可以出现肝区疼痛，出现阻塞性黄疸，肝功能受损等症状，肝内胆管结石直径小，未导致胆汁阻塞，是可以保守治疗，口服医院所开的口服药物，如果结石较大，出现嵌顿，还是选择手术治疗。
