对于肝囊肿的治疗是选择手术治疗为主，可以适当的选择观察肝脏的大小，是否有临床主要症状，定期观察就可以，如果直径大于五厘米或者临床主要症状比较明显，还需要适当的选择手术治疗。
大多数肝囊肿都是先天性的，对人体没有特别大的危害，基本不需要治疗，如果体积特别大，可能会进行一定的治疗。它对人体的危害也不是特别的大，它和肝癌和其他的肝脏的疾病没有太多的关系。
大多数的肝囊肿都是先天性的，其属于良性病变，所以对寿命的长短没有太大的影响。肝囊肿比较严重，甚至合并了多囊肾的人，影响到肾功能，出现肾衰竭，这样才会影响到人的寿命。如果出现肝囊肿后，能积极地治疗，一般是不会发展到这种地步的。
一般比较早期的囊肿在其比较小的时候，可以通过局部制动、按摩的方法消除。当囊肿逐渐长大后可以先尝试用力按压挤破囊肿，可也以暂时消除，但是一般容易复发。如果囊肿生长部位不影响患者生活，也可以不做处理。
肝囊肿和肝癌的CT鉴别，主要表现在肝囊肿是一个低信号的良性肝内占位，而肝癌是一个低密度或者是等密度的占位。它们的鉴别主要是通过肝脏的增强CT来看，囊肿是不会有增强的，不会有强化；而肝癌多半是由肝动脉供血或者是静脉供血，会有增强期、动脉期，会有强化。
肝囊肿增大会有破裂的危险，严重时会危及生命。到正规的专科医院进行全面的检查。囊肿大于3厘米，应穿刺抽液后，用中药进行调理，改变全身的内环境，将囊液慢慢吸收，达到治疗的目的。平时清淡饮食多吃新鲜的水果和蔬菜，避免辛辣刺激和油炸食品的摄入，避免剧烈运动，或者弯腰，以免囊肿破裂等。
