甲状腺炎患者明确为细菌炎症引起的急性化脓性甲状腺炎时，可服用头孢菌素类或青霉素类消炎药，如头孢呋辛酯或阿莫西林克拉维酸钾等。
病毒感染引起甲状腺炎的情况下，服用抗炎药物症状往往不会好转。该病毒感染引起的甲状腺炎是由流感病毒和腺病毒引起的，因此需要口服非甾体类消炎药才能有效缓解甲状腺炎症状。可以先口服布洛芬缓释片或洛索芬钠片。如果患者症状不能缓解，也可以采用激素类药物口服治疗。
如果是术后甲状腺功能减退，需要终身用药的。手术后恢复良好的病人也可以慢慢停止服药。因此对于严重病例，应及时进行手术以防止病情恶化。它主要见于年轻人和中年人，在30，50岁的妇女中发病率很高。
是不能治好的。依据血中甲功的结果、相关抗体是否升高，甲亢和甲减期。甲亢期不严重，是不用治疗的，甲亢持续数天或者数个星期之后自动成为甲减期。甲减期需要药物治疗，终身口服药物，补充甲状腺激素，定期需要门诊复查甲功。
甲状腺炎如长期淋巴细胞性甲状腺炎出现甲状腺功能不正常，通常情况下，甲减出现概率较高，甲减的发生需甲状腺激素代替治疗，并定期监测甲状腺功能改变，调节甲状腺激素剂量。
在妊娠期间一般都不使用甲状腺素片进行辅助治疗，但是对于一些特殊类型的甲状腺肿瘤，则需要采用甲状腺素片联合亚叶酸钙或者甲状旁腺素等药物进行治疗。如产后甲状腺炎，大多数产妇甲状腺炎可随时间推移而逐步改善。
有些病人可有甲状腺功能减退，需使用甲状腺激素进行药物替代，如亚急性甲状腺炎，通常情况下，非甾体类抗炎药的使用，严重者需加激素处理。
甲状腺炎有好几种类型，其中以桥本甲状腺炎最为多见、亚急性甲状腺炎等、化脓性甲状腺炎等。
桥本甲状腺炎主要导致甲减，一旦造成甲减，甲状腺激素需终生补充。对于慢性甲减要及时治疗。亚急性甲状腺炎等，视情况需短期使用，非甾体抗炎药或糖皮质激素。慢性甲亢患者需要长期服用抗甲状腺药物。化脓性甲状腺炎需短期静脉或口服抗生素治疗。
