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横纹肌溶解综合征最严重的并发症是产生的肌酸激酶堵塞肾小管，引起急性肾衰竭。所以治疗上一定要注意补液，已经出现了肾功能的衰竭，尿液减少或者无尿，肌酐增高，可以短期给予血液透析治疗，并给予保护心肌、肝脏、肾脏等治疗。
横纹肌溶解综合征常常出现在剧烈运动、外伤、挤压等情况下，首先会表现为肌肉酸痛、肉眼血尿，尿色加深可呈酱油色，其原因是因为肌细胞损伤，血里面出现大量的肌红蛋白，超过了肾小管的重吸收能力。
通常情况下，新生儿急性肾功能衰竭要做尿常规、血清肌酐、血尿素氮等检查。具体分析如下：
新生儿急性肾功能衰竭是指新生儿由不同病因使肾功能在短时间内受到损害，新生儿呈现血容量低下休克、缺氧、低体温等多种病理状态，是新生儿危重临床综合征，需要及时进行检查，然后对症治疗，需要做尿常规、血清肌酐、血尿素氮等检查。
急性肾功能衰竭症状主要是小腹坠痛，局限性肾坏死，胸闷、表情淡漠、蛋白尿、血尿，伴有高血压，心力衰竭，心内膜炎、贫血、癫痫、头痛等症状，严重的还会出现水中毒、高钾血症、代谢性酸中毒、氮质血症，甚至危及生命。
横纹肌溶解症，又称肌球蛋白尿，是指尿液中存在大量的肌肉蛋白和肌球蛋白。肌球蛋白本身可直接损害肾小管的表皮细胞，也可导致肾本身的血管收缩。另外，肌球蛋白在酸性或体液不足的环境下，容易在肾小管内结晶，进而阻塞肾小管，因此横纹肌溶解症易发生急性肾功能衰竭。
新生儿急性肾功能衰竭主要治疗方法是病因治疗。
第一，明确导致肾功能衰竭的原因，是治疗的方向。新生儿可能有脱水的状态，或有效血流量不足，导致肾功能衰竭。
第二，溶血，新生儿容易有溶血尿毒综合征，溶血导致肾功能衰竭，要看血型检测。
第三，肾脏尿系统发育异常或先天发育异常，导致结构性改变引发肾功能衰竭，要完善泌尿系彩色多普勒超声检查，化验尿常规，初步检查肾脏损伤情况及损伤部位。
