原因是饮食不当，食辛辣刺激性食物，消化道末端肛门神经受到刺激会产生肛门瘙痒感。或者是个人卫生习惯不好，不及时清洗肛门会阴部位，肛区就会产生大量污垢及增生细菌，进而刺激肛周皮肤，产生瘙痒感。
肛门瘙痒的大部分原因是肛门直肠疾病引起，如痔疮，肛门失禁等。刺激肛门腺，导致肛门腺体分泌物增加，引起肛门关闭不严，导致直肠分泌物外溢。最终引起肛门潮湿，肛门皮肤潮湿的环境又给细菌的寄生创造了环境，共同作用引发肛门瘙痒。辛辣食物的过量摄入，肥胖，臀沟过深，多毛症，焦虑也有可能引起肛门瘙痒。
很多人都不太注意个人卫生，从而引起的肛门瘙痒：局部卫生差，不常清洗，使粪便刺激皮肤。这种现象常出现在条件差的人群，皮肤病引起的肛门瘙痒，气候寒冷干燥引起的肛门瘙痒，内衣过紧，摩擦皮肤，这些都会引起肛门瘙痒，需要注意自己的个人卫生。
痔疮因局部外痔突出而引起肛门瘙痒，皮肤皱褶中极易漏少量粪渣，刺激局部组织产生皮炎和湿疹，痔疮反复脱垂，直肠粘膜分泌增多，导致部分肠分泌物向肛周皮肤渗出，刺激局部瘙痒。大便后，温水坐浴，若瘙痒症状严重，治疗内痔和外痔，减少局部刺激。
平时常见的引起肛门瘙痒的原因包括肛门直肠的疾病，比如肛裂，肛窦炎，肛瘘，肛乳头炎，肛门失禁等这些疾病都会导致肛门的分泌物增多，肛门潮湿引起皮肤瘙痒。其次包括肛周的皮肤病，比如肛门湿疹，性病，各种疣。
肛周因瘙痒出现局部的抓痕，有血痂，可引起肛门局部的疼痛，甚至皮肤出现小的裂口而引起局部渗血，长期的肛门瘙痒还引起肛周皮肤皱褶的增厚，如出现纹理的加深增宽。
