一般情况下，肥厚性心肌病能手术，具体内容如下：
如果患者患有肥厚性心肌病，但使用药物治疗该症的作用并不明显，或患者已经出现了比较严重的流出道梗阻，患者可以遵医嘱接受室间隔切除术来进行治疗，从而控制病情发展，缓解患者的不适症状。在进行手术前，患者应完善各项检查，以排除各项手术禁忌症，以免身体无法耐受手术。
肥厚性心肌病需根据具体病症进行治疗。
肥厚型心肌病一时之梗阻性肥厚型心肌疾病，针对该病的治疗，可以选择药物保守治疗，常用的药物有纠正心衰的药物、逆转心室重构的药物，例如β受体阻滞剂等。梗阻型肥厚性心肌疾病比较危险。因为梗阻往往会出现低血压、恶性心律失常、心绞痛等症状。如果心排血量受阻，会导致机体供血不足，脑供血不足，冠状动脉供血不足，这是非常危险的。一般都会选择无水酒精消融，这样可以减轻梗阻，从根本上治疗。
肥厚性疾病的处理相对困难，以不一定能根治为主。
肥厚性心肌病以改善症状为主，降低并发症，防止猝死的发生，其中，药物治疗为肥厚性心脏病治疗提供了依据，以流出道梗阻为治疗目标的药物包括β受体拮抗剂，非二氢吡啶类钙通道阻滞剂等。当存在心衰时需针对心衰进行药物治疗，在伴有房颤的情况下，需给予抗凝治疗。对胸闷不舒服患者，应用硝酸酯类时，应引起重视，要排除外流道梗阻，以免用了以后加重病人的病症。非药物治疗以手术为主，酒精室间隔消融术为辅，及起搏治疗，对现在的病人普遍建议酒精室间隔消融，但还需结合适应症而定。
肥厚性心肌病是不能完全治愈的，只能维持患者病情稳定，延缓患者心脏功能减退的进程。
肥厚性心肌病是目前引发我国青少年运动性猝死的主要原因，因此在日常生活中，诊断为肥厚性心肌病的患者应避免剧烈运动，以免剧烈运动时，心脏供血不足，引发脑供血不足，全身循环血量不足，恶性心率失常等。但是如果可以找到合适的心脏供体，行心脏移植术，本病即可治愈。但综合各方面条件，如心脏移植供体来源稀缺，移植排斥反应，体外循环感染等情况，导致其风险较大。肥厚性心肌病主要是与遗传有关。
对于没有明显的临床表现，没有明显的临床表现是可以不必进行治疗的，这是由于病人的生命中没有明显的表现。若病人有临床表现，并有可能是因此病所致，可以服用美托洛尔，服用美托洛尔片；若病人的病情没有好转，可以转而使用维拉帕米。同时伴有心脏功能不全的病人也可以使用呋塞米片利尿；同时出现心律不齐的情况下，可以口服氨碘酮来提高心率。
肥厚性心肌病的预后有较大的不同。
对梗阻性肥厚性心肌病（简称梗阻性心肌病），部分于青少年时期及活动期间突然死亡，部分逐渐发生心力衰竭（心衰），进展至终末期心衰（心衰），最终死于心力衰竭，感染及其他疾病。而部分病人（以非梗阻型肥厚性心肌病为主），临床表现较轻，大多在平时健康查体中被检出，对一般日常活动无影响，临床症状较轻，寿命与正常人相近。
