肾小球肾炎的治疗需要确定病人是急性肾小球肾炎还是慢性肾小球肾炎。对于急性肾小球肾炎，通常治疗链球菌感染。大多数病人在三到四周内恢复。慢性肾小球肾炎通常需要肾活检。根据24小时尿蛋白定量，肾活检病理决定是否使用激素或激素联合免疫抑制疗法。
目前我国儿童肾小球肾炎发病率较低，治疗主要根据致病原因、疾病类型、病情严重程度。
目前治疗肾炎的药主要有：免疫抑制剂、抗感染药、利尿剂、降压药、降脂药、抗凝药、血小板聚集药、保肾排毒药等，医生根据患者的具体情况及化验指标变化调整药物种类和剂量。急性期患者要卧床休息，症状明显的患者卧床4-6周，血压平稳、水肿消退、肉眼血尿消失、尿常规及其他检查正常后可逐步活动。
建议细菌培养阳性时应积极使用抗生素。并有防止细菌的传播作用，为期2周或直到治。辅以利尿、补钾、急性肾小球肾炎出现以下情况，应采用透析治疗，严重水钠潴留；急性肾功能衰竭，少尿2天以上，血钾高急性左心衰竭，严重酸中毒。
肾小球肾炎是不能根治的，但可以临床治愈，如果疾病管理的好，是可以和正常人一样寿命的，但容易反复发作，治疗的时候需要关注远期疗效，如果只关注指标不关注病人的身体感受，就容易反复发作，反复发作频繁还会造成病情加重。
肾小球肾炎的病人要注意监测体重，因为水肿的时候，体重会有明显的变化。要在家买个电子血压表，自我监测血压，同时应该到医院做尿常规、肾功能、血电解质、肝功能、血的总蛋白、白蛋白、血糖、内生肌酐清除率、24小时尿蛋白定量以及IgA、IgG、IgM、补体C3、C4、C-反应蛋白、类风湿因子、自身抗体、肝炎病毒的标记物等检查。
肾小球肾炎和肾病综合征是有一些区别的，肾小球出现无菌性的炎症一般称为肾小球肾炎，轻度的尿潜血阳性是它的一般表现，并且可能会出现甚至可能出现大量的蛋白尿，如果一天内尿蛋白定量超过3.5克以上，认为它为肾病综合征。
