一般情况下，头顶百会穴疼痛大部分是由于没有休息好或者劳累、淋雨、饮酒等诱因造成。紧张型头痛、神经痛的病人也会出现头顶百会穴胀痛不适。
人体的一些全身性疾病，比如高血压、脑血管痉挛、脑供血不足等，也会出现百会穴疼痛的情况。同时由于头部局部的一些病变，比如偏头痛、神经痛等，也会引起百会穴疼痛，需要积极治疗。
可服用药物治疗；也可采用，针灸，中药调理，心理疏导等方法治疗。平时应注意低盐低脂饮食。避免喝酒抽烟。避免吃辛辣刺激性的食物。注意劳逸结合。保持良好心情。避免情绪过度波动即可。
一般来说，针灸百会能治痔疮。
百会治疗痔疮比较合适得痔疮的时间比较久，伴有脱肛、神疲乏力的等症状的患者。因为百会属于督脉，而督脉总管人体的六条阳经，可以调节全身阳经经气，升举阳气，防止下陷的作用，对于痔疮的治疗有一定作用。
建议患者平时注意营养均衡，多吃新鲜的水果、蔬菜，并适当运动，比如慢跑、游泳等。
灸百会有帮助睡眠、开窍醒脑、减轻头晕等功效，具体分析如下：
1.帮助睡眠：很多人都有失眠的困扰，可以通过灸百会来缓解失眠的症状，缓解精神上的抑郁、烦躁。
2.开窍醒脑：有些老人会有记忆力减退，反应也比较慢，通过灸百会可以让人的头脑更加的健康，对于精神错乱、健忘症等病症也有很好的效果。
3.减轻头晕：灸百会具有疏通经络、缓解疼痛的功效，可用于头晕、眼花、头痛等。
在头顶正中心，以两边耳尖划直线与鼻子到后颈直线的交叉点，或以两眉头中间向上一横指起，直到后发际正中点。此穴为人体督脉经络上的重要穴道之一，是治疗多种疾病的首选穴。
通常情况下，头部百会穴痛可能是疾病导致的。
头顶部百会穴发生疼痛症状，若有打喷涕、流鼻水症状，很有可能与发烧感冒相关。头部百会穴痛也有可能与毛细血管紧张性疼痛相关。通常与紧张焦虑、工作压力、恼怒、激动、热冷刺激性、严重休息不好、劳累过度等相关。疼痛比较严重时，伴四肢麻木、活动受到限制症状。很有可能与出血性脑血管疾病，或脑缺血脑血管疾病、大脑供血不足、缺血性、氧气不足造成的疼痛和颅内压升高等相关。应当在医院体检明确发病原因后再医治。
