巧克力囊肿属于子宫内膜异位症，巧克力囊肿时会影响卵巢的排卵，导致卵巢的功能破坏，不排卵导致不孕。同时：子宫内膜症还有可能发生盆腔内，输卵管，子宫。卵巢的粘连，导致盆腔内的大部分器官完全粘连。
巧克力囊肿出现月经量少是正常，可能是引起了月经紊乱导致的。巧克力囊肿又称为卵巢内膜异位囊肿，是子宫内膜异位症的一种病变，当月经脱落的子宫内膜碎片随经血逆流输卵管进入盆腔，种植在盆腔，可形成异位囊肿，受雌激素营养，发生周期性的月经出血，使卵巢增大，可出现陈旧性的出血。
子宫内膜异位症的一种病变，这种囊肿可以逐渐增大，有时会在经期或经后发生破裂。治疗方面，还未生育的年轻女性一般采用药物治疗并定期随访检查。若症状较重，经药物治疗效果不明显，或卵巢有较大包块的，可以采用保守性手术，如卵巢内膜囊肿巧克力液抽吸术，内膜囊肿剥除术或患侧卵巢切除术，以保留正常卵巢和生育功能。
月经过少是指，月经周期正常，每次行经天数短于3天，经血量每次不超过20ml。经血量色淡或深。引起月经过少的原因是垂体功能低下，导致卵巢雌激素分泌不足，使子宫内膜增生不够。
附件疾病如囊肿、肿瘤等不会导致阴道出血的。发现阴道不规则出血，应引起高度重视，及时检查，明确诊断后对因治疗。做一下阴道镜细查一下确诊，或是内分泌紊乱、服用药物等都有可能引起的。
术后巧克力囊肿的一年复发率是10-18%，月经不来不一定会导致复发，还是上医院检查比较好，而且不健康的饮食易导致巧克力囊肿的复发。所以在日常饮食中要注意做好饮食调节，保证饮食多样化，及时补充人体所需的维生素及矿物质，多吃水果、蔬菜，增强人体抵抗力，从而可以有效预防巧克力囊肿复发。
