当囊肿小于五厘米的时候，是不需要治疗的，定期复查就可以，对于5到8厘米的，可以治疗也可以不治疗，这得看病患的情况，但是低于八厘米以上的囊肿，一般是建议手术治疗的。
不管注意饮食，甚至吃药，都没有办法确切的把囊肿给弄掉。如果囊肿一直是维持比较小的状态，那就定期一年左右做个B超看一下，如果囊肿很大，大于五六公分，那就可以考虑，进行一个穿刺治疗，或者进行微创的手术，来治疗肾囊肿。
无症状的肾囊肿一般不需要治疗。若囊肿有压迫症状了，建议早期手术治疗是最好的治疗方法。手术减轻了囊肿对肾实质的压迫，保护了大多数剩余的肾单位免遭挤压和进一步损害。
肾囊肿可以采用中药进行治疗，只要平时在饮食注意，不要吃辛辣刺激、被污染的、烧烤类的以及腌制的食物即可，如果情节严重只能进行手术治疗，肾囊肿也没有什么食物能够消除，只需注意平时饮食清淡、吃一些容易消化的食物，作息时间规律。
可以采用超声进行监测，如果是囊肿直径大于四个厘米，可以在超声引导下进行囊肿穿刺并引流囊液，同时可以使用95%的乙醇或者四环素作为硬化剂注入囊腔内。但是如果肾囊肿直径大于八个厘米，可能需要手术治疗，有条件者可以行腹腔镜下肾囊肿去顶术进行治疗，这种手术创伤小，疗效确实，术后患者恢复快，已经成为治疗有手术指针的单纯性肾囊肿的精标准方法。
