肾囊肿穿刺后至少要休息半个月左右，肾囊肿穿刺抽液术后，会有一过性的血尿存在，并可能会有一段时间。目前主要是防止继发泌尿系感染。血液是一个良好的天然培养基，很容易滋生细菌。要积极抗炎治疗，做好预防工作，以免发生肾盂肾炎疾病，影响肾脏代谢和功能。
目前，肾囊肿还没有好的特殊治疗方法。如果囊肿相对较小，囊肿的大小只能在任何时候通过观察来检查。如果囊肿相对较大，那么就需要手术。这个肾囊肿不经治疗是无法恢复的。平时，应注意饮食，控制囊肿的发展。
肾囊肿没有明显的特效药。发现肾囊肿要看囊肿的大小，对于小囊肿没有症状时不需要做任何治疗，定期复查看，特别是小于4厘米以上的，观察囊肿是否继续增大，无症状者要经常做尿液的检查和泌尿系统超声检查。对于大于5公分肾囊肿，采取手术治疗。
不管中药还是西药肾囊肿靠药物是无法治疗的，由于单纯性肾囊肿多无症状，对肾功能和周围组织影响不大，因此不需治疗，只要6个月到1年随诊。如果囊肿直径较大，超过5cm或产生周围组织压迫症状，引起尿路梗阻，则需要行囊液抽吸术并囊内注射硬化剂。如果囊肿巨大，直径超过10cm则可能需要手术治疗。
肾囊肿不管中药还是西药，靠药物是没有很好的效果的，由于单纯性肾囊肿多无症状，对肾功能和周围组织影响不大，因此不需治疗，只要6个月到1年随诊。如果囊肿直径较大，超过5cm或产生周围组织压迫症状，引起尿路梗阻，则需要行囊液抽吸术并囊内注射硬化剂。如果囊肿巨大，直径超过10cm则可能需要手术治疗。
