区别是，氟桂利嗪和桂利嗪的功效不同，治疗的疾病不同，服用方法不同，副作用不同，在服用桂利嗪时，会出现用药导致头晕眼花、共济失调、口干、视力模糊、便秘、等不良反应。因为氟桂利嗪是桂利嗪的二氟化衍生物，副作用为体重增加，溢乳等。
氟桂利嗪有缓解血管痉挛、前庭抑制、抗癫痫、保护心肌、改善肾功能等作用。主要用于脑血管功能障碍，可明显改善其引起的各种主客观症状，包括头痛、思想不集中、睡眠紊乱等。
桂利嗪是一种钙通道拮抗剂。它可通过阻止血管平滑肌钙内流，引起血管扩张，从而改善脑部的供血。目前多用于治疗缺血性脑血管病（包括脑血栓形成、脑栓塞、脑动脉硬化等）、脑出血恢复期、蛛网膜下腔出血恢复期、脑外伤后遗症、眩晕症、冠状动脉硬化及由于末梢循环不良引发的疾病；对慢性荨麻疹和老年性皮肤搔痒等皮肤病也有一定帮助。
这药的副作用有，消化方面的问题，有可能会出现反酸、烧心、恶心，纳差，再就是有可能会导致失眠、焦虑。还可能会导致肌肉酸痛，个别患者有可能会导致抑郁，尤其是有抑郁病史的女性，有可能更加容易导致抑郁症，会出现运动的迟缓，静坐不能，震颤，个别的还会出现体重的增加。
盐酸氟桂利嗪口服溶液是可以治疗头痛的，本品的主要成分为氟桂利嗪，通过口服给药后能加快脑部血流的循环速度，显著降低疼痛敏感性.本品主要用于治疗脑动脉供血不足耳鸣头晕偏头痛等疾病的治疗。
