自然流产第三天了腰疼可能是多种原因导致的，具体分析如下：
如果女性在自然流产后三天会感到腰痛，可能是由于受了某种寒气的刺激，也可能是由于没有休息好，也可能是由于工作过度导致的。在流产后要多休息，不要过度劳累，不要做太多的体力活，要让自己的情绪得到充分的释放。同时要注意保持外阴的卫生，经常更换卫生巾，在一个月之内不能同房。需要到医院做个全面的检查，确定是什么导致了自然流产，然后才能对症治疗。
一般情况下，流产后腹痛可能由以下原因引起:
一是比较敏感，疼痛是术后器械刺激引起子宫收缩引起的。
二、子宫穿孔引起的疼痛往往会导致小腹剧烈疼痛，面色苍白，出冷汗。
第三，有可能是子宫内有残留组织，没有吸干净造成的疼痛。建议患者尽早进行b超检查和妇科检查，根据结果及时治疗。患者应多休息，注意饮食清淡、营养，作息规律，有利于保持身体健康。
流产之后肚子肯定会疼的，因为流产之后子宫要收缩，通过不断的收缩，从而达到促进子宫恢复和排除瘀血的目的。子宫在收缩的过程中间，就会出现疼痛的感觉，这种疼痛基本都可以耐受，有点类似痛经状。
肚子当然是会疼的，但是疼痛的程度是看个人的身体状况来决定的。在怀孕初期的时候出现流产，孕妇肚子会出现不同程度的疼痛，每个人身体素质不一样疼痛感也不一样的。
流产第三天肚子疼怎么办需根据实际情况来判断，具体内容如下：
人流手术出现腹部疼痛，有宫缩的症状，也有可能是流产不全，也有可能是淤血。可以到医院的妇产科做一些检查，比如子宫附件彩超、绒毛膜促性腺激素等。流产不全需要进行清宫，也可以通过药物进行治疗。口服益母草颗粒、强力生化胶囊等，还可以口服一些抗生素来防止感染。平时要多注意保暖，避免食用辛辣刺激的食品。
