苦瓜中含有较多的草酸，草酸能与食物中的钙结合，影响人体对钙的吸收。若长期大量食用苦瓜，会导致钙质缺乏症。苦瓜含有一种叫“多肽—P”类似胰岛素的物质，具有降糖的功能，因而，患有低血糖的不宜多食。苦瓜性味苦寒，多食易损脾败胃，因此不要空腹食用，脾胃虚寒、慢性胃肠炎患者应少食或不食。此外，处在月经期时，也应暂时和苦瓜保持距离。
喝苦瓜泡的水可以开胃、生津、促进消化。另外，因为苦味的东西有通降作用，所以苦瓜泡水喝可起到利尿、降压、降脂、降糖等作用。还可以抗紫外线、抗辐射、抗肿瘤。苦瓜因为是寒性的，具有清热解毒作用，可以用于美容，对体质热产生的痤疮，可起到一定的清热解毒作用，同时还可以提高机体免疫力和抗衰老。
苦瓜的新鲜汁液，含有苦瓜甙和类似胰岛素的物质，具有良好的降血糖作用，是糖尿病人的理想食品。对于女性来说，苦瓜有很好的美容功效，富含多种维生素、矿物质，可以治疗青春痘，滋润皮肤。
有清热益气的功效，可以帮助人体补肾健脾，明目等等，对于中暑以及结膜炎等等病症都有一些功效。还有就是具有预防坏血病、提高机体应激能力、保护细胞膜、防止动脉粥样硬化、保护心脏等作用。
孕妇在怀孕期间吃苦瓜不好。
孕妇在怀孕之后最好不要吃苦瓜，因为苦瓜中含有奎宁，会刺激子宫收缩，引起流产。但如果在怀孕三个月之后，只是偶尔少量的吃一些苦瓜，则不会对胎儿的发育造成影响。孕妇在怀孕期间的饮食还是要营养均衡，荤素搭配，多食用应季的新鲜蔬菜、水果，少吃或不吃辛辣、刺激的食物，每天保证充足的睡眠。
