支原体感染为目前尿道感染中常见微生物种类，包括解脲支原体、人型支原体等，通常都使用抗生素治疗。
支原体感染建议口服药物以大环内酯类药物为主，代表性药物有阿奇霉素分散片、盐酸多西环素胶囊等。若上述药物没有用处，身体无法承受副作用，亦可换成琥乙红霉素片治疗。
通常情况下，儿童支原体感染服用中药是无效的。对于治疗支原体感染，最直接有效的办法就是使用大环内酯类抗生素来控制感染，最常见的是阿奇霉素分散片、罗红霉素分散片，如果孩子出现发烧的情况，可以通过静脉注射阿奇霉素。
中医不能直接治疗支原体感染，可以口服银黄颗粒、复方金银花颗粒、小儿双黄连口服液等清热解毒的中成药。
通常情况下，男性支原体感染吃药能治愈。不过要对症下药，具体分析如下：
1、肺炎支原体感染会引起肺炎症状，治疗首选阿奇霉素。
2、人型支原体可能会引起男性前列腺炎，首选四环素或克林霉素类治疗。
3、解脲脲原体可导致男性精子发育异常，导致男性不育，采用红霉素、四环素、多西环素等都有效。
怀孕支原体感染尽不要吃药，严重者可慎重选择适合的药物。
怀孕支原体感染症状轻微的时候建议随访观察，尽量不要使用药物，以免影响胎儿的发育。若病情严重，再考虑使用一些药物控制病情，可选药物为红霉素、阿奇霉素等，但是必须谨慎，遵医嘱用药。停药3周后再次进行支原体检查，结果无异常，病症消失基本就是痊愈。还要注意对个人用品进行消毒，预防复发。
如果出现支原体感染，可以通过口服药来治愈。
如果是支原体感染，可以选择阿奇霉素、左氧氟沙星、四环素等抗菌药物进行治疗。在治疗过程中要加强自身的卫生，尽量不要有性生活，以免发生相互感染。其次，女人要多饮水，注意饮食，不要吃辛辣刺激性的食品，比如大蒜、酒类、辣椒等。
妇科支原体感染吃药能好，阿奇霉素是治疗的第一选择，如果是反复感染的话，有很大的几率会对抗生素有抗性，需要进行药敏试验，比如罗红霉素、红霉素等。支原体的感染一般都是通过同房来传播的，因此在治疗的时候要尽量避免同房，避免把病毒传染到自己的性伙伴身上。