指甲有横纹，凹凸不平，首先考虑指甲营养不良，或者和胃肠道吸收功能不好有关。平时注意营养均衡，多吃蔬菜水果，适当的补充微量元素和维生素。建议如果想明确，还是要抽血查一下微量元素的，血常规，铁蛋白和维生素b12及叶酸含量。
一般情况下，大拇指甲盖凹凸不平可能是缺钙、甲癣等因素造成的，具体内容如下：
1.缺钙：如果患者存在营养不足的情况，体内可能会缺钙，可能会对指甲的生长造成一定的影响，可能出现大拇指甲盖凹凸不平的情况。患者可以遵医嘱使用葡萄糖酸钙口服溶液等药物进行治疗。
2.甲癣：真菌感染可能诱发甲癣，可能导致患者大拇指甲盖凹凸不平，还可能变脆、发黄。患者应及时就诊，遵医嘱使用盐酸特比萘芬软膏等进行治疗，以免病情进一步发展。
指甲凹凸不平可能与外伤、营养不良、银屑病、特殊行业等因素有关。
1、外伤：指甲局部受到外伤，属于一过性的损伤，可能会出现指甲不平的现象。
2、营养不良：另外如果身体缺乏微量元素以及缺乏必要的营养物质，造成了营业不良，也会导致指甲的凹凸不平。
3、银屑病：银屑病患者会出现指甲凹陷的特征。多由真菌引起的，真菌侵犯指甲部位后，指甲的表面开始感染，形成凹凸不平的改变。
4、特殊行业：特殊行业的人群，指甲长时间接触一些特殊的化学物质，也可能会造成指甲凹凸不平。
指甲表面有凸起的棱线，或是向下凹陷。中医认为“肝主筋”，指甲是“筋”的一部分，所以毒素在肝脏蓄积时，指甲上会有明显的信号。如果指甲过白或是慢性贫血或肝、肾有问题。指甲凹凸不平，若还有出现一条条的条纹，可能是肝不好。
指甲表面凹凸不平主要是见于微量元素缺乏，补充钙剂，应该注意日常不要偏食，平时除食用富含动物性蛋白质的肉、蛋、禽类等，宜多进食一些含脂肪、碳水化合物（即淀粉、糖类等）较丰富的食物，还要适当多吃一些豆制品及蔬菜、瓜果等。
指甲凹陷，扁平或呈勺状与缺铁性贫血，梅毒，甲状腺疾病，风湿热有关，这也提示身体内钙质，蛋白质，的缺乏，这些营养物质可以从蛋类，大蒜中取得，健康指甲应平滑光洁，甲面无纵横沟纹，甲上无干扰斑，指甲对称，不偏斜，无凹陷或未端向上翘起现象。
