通常情况下，儿童慢性结膜炎用抗生素滴眼液比较好。
儿童慢性结膜炎比较常见，可能是不注意眼部卫生、用眼不良等因素引起的，家长可以在医生的知道下给儿童使用妥布霉素滴眼液、氧氟沙星滴眼液等眼药水比较好，具有抗菌、消炎的作用，能够有效缓解症状。此外还可以用红霉素眼药膏，通常也能缓解儿童慢性结膜炎的症状，通常副作用比较小。
一般来说，儿童过敏性结膜炎用抗炎抗过敏药。
过敏性结膜炎又称为变态反应性结膜炎，是结膜对外界变应原产生的一种超敏反应。可以使用抗炎抗过敏药物糖皮质激素如泼尼松眼药水、H受体阻滞剂如奥洛他定眼药水等来治疗，也可以吃扑尔敏来治疗。家长需要带孩子到眼科检查原因，然后对因对症治疗。家长要适当调整小儿的饮食结构，尽量以清淡为主。
慢性结膜炎通常是由于不注意眼睛卫生引起的，可以局部使用药物进行治疗。平时要注意眼部卫生，经常洗手，避免熬夜，少接触电子产品，避免过度劳累，增加户外活动，在远距离睡觉前进行适当的热敷和按摩，慢慢改善。
一般情况下，妊娠妇女都会使用一些抗菌药物来治疗疾病，如青霉素类、头孢菌素等。
抗生素对细菌性结膜炎有优良的疗效，对病毒性结膜炎的治疗虽然无效，但还有防止细菌感染。在怀孕期间，由于胎儿的不断发育，身体抵抗力会越来越弱，很容易受到病菌和病毒的侵害而引起炎症，导致眼部发炎或视力下降等症状。因此，孕妇患结膜炎的话，眼药水和眼药膏都要专人专用。另外，在用药时要注意避免使用刺激性药物和激素类眼药品种，因为激素有刺激眼部黏膜和结膜细胞生长等不良反应。
小儿结膜炎通常会出现严重的症状，主要是由于眼部肿胀、结膜充血、渗出、发热等。对于儿童的结膜炎，需要引起足够的注意。使用不含有任何防腐剂、不刺激性或不含任何防腐剂的滴眼液，例如：乳酸左氧氟沙星眼药水和利巴韦林眼药水。如果需要，可以服用一些抗菌药物。眼睛的分泌物要尽快清洗。在夜间使用红霉素的眼睛。要经常洗手，避免用手搓眼。要多摄入维生素丰富的食品，并且要有足够的睡眠。
过敏性结膜炎可以在短时间的几个月内治愈；如果是长期的，可能需要数年的时间。具体的治疗时间要视情况而定，大部分都能在短时间内恢复。
春季过敏性结膜炎在反复发作后，会持续数年。小儿过敏性结膜炎可以用药物进行抗过敏治疗，但药物抗敏治疗仅能抑制过敏症状，预防和维护是非常关键的。在花粉最多的时候尽量不要出门，最好是带上护目镜。大部分的孩子都不能确定过敏源，所以孩子的过敏性结膜炎复发很难根治。
