CA125不是一项特异性的指标，所以它也可由其他的病因引起升高，例如一些炎症，乳腺炎等均可引起CA125的升高。而CA199偏高也可有组织病变，恶性肿瘤，病变时分泌亢进所形成CA199的指标升高。但CA125和CA199一起偏高，可能是存在某些良性病变，例如消化道炎症，肝硬化等。
引起ca199偏高的原因很多种，但总结为一点就是身体的免疫细胞在下降，需要引起重视，它升高就是身体发出警示，应该注意免疫细胞了。增高见于消化道部位恶性肿瘤外，还可见于胰腺炎、肝炎、胆结石、肝硬化等疾病。
CA125是一种来源于胚胎体腔上皮的糖蛋白，升高多见于上皮性卵巢肿瘤的患者，但对于卵巢肿瘤的诊断，它的特异性却不高，在结核性腹膜炎的患者中，CA125也可升高至数十倍，所以单纯CA125的升高并不可以诊断为卵巢肿瘤，可以用B超进行辅助检查。
不能将CA19-9来作为胃癌的诊断或筛检的指标，无论它的值偏高多少。CA19-9用来预测胃癌的敏感性较低，糖链蛋白19-9血中浓度升高的病患中，胰脏癌以及胆道癌发生机率较高。除了胰脏癌及胆道癌之外，还可以在结肠癌、直肠癌、肺癌等癌症患者查到CA19-9指标升高。
在临床上它与肿瘤没有明显的相关性，但是肿瘤的发生可以引起糖类抗原CA199的升高，那么对于不同原因所引起的糖类抗原ca199偏高，需要选择不同的方法来进行治疗。口服对症药物治疗。
糖类抗原CA199是胰腺癌和胆囊胆管癌的标志物。对于胰腺癌或胆管癌或结肠癌在治疗过程中如果出现CA199在原来的基础上有了明显的增高，须详细检查是否出现了肿瘤复发或转移。另一方面胰腺炎、阻塞性黄疸、肝炎、肝硬化、支气管扩张等也会出现CA199的偏高。因此未得过肿瘤，如果出现CA199偏高，也应该做相关的检查排除相关的良、恶性疾病。
