生殖器疱疹会有疼痛，有的人疼痛的比较厉害，生殖器疱疹是有单纯疱疹病毒感染引起的，在生殖器官周围会出现单个的或是成簇的小水泡，几天后水泡会破裂出现糜烂和溃疡，所以会有疼痛的感觉。
生殖器疱疹一般潜伏期是2-14天左右，在皮肤上出现散在的小水疱，或者是簇集状存在的小水疱。小水疱一旦出现以后，2-4天会自己破溃，形成浅浅的溃疡，然后慢慢会愈合。此过程中会有明显的疼痛感。
生殖器疱疹是由单纯性Ⅱ型疱疹病毒引起，这种病毒相当顽固，要治疗，必须把以内的毒素彻底杀死即可治疗，采用可使体内产生大量的内源性传统中药配合治疗，可以阻断疱疹病毒DNA的复制，就像给人结扎一样，使其不能产生新的病毒。
出现这种病情和生殖器疱疹有关系，另外也可见于坐骨神经痛，腰椎病变等导致，出现疼痛，可以服用药物治疗，到医院外科再复查一下腰椎片等检查看是否有异常，根据检查进行治疗。
生殖器疱疹是会导致有尿痛的表现的，这时要及时的选择使用药物才能更好的控制尿痛的表现，尽量的是不要吃鱼虾那些的食物，会加重疱疹的现象，要多喝水才是可以有效的帮助排尿，控制好了疱疹，尿刺痛的感觉都可以控制好的。
生殖器疱疹的初是进食困难，出现窒息：损害要是发生在口腔或咽喉部位的话，可出现进食困难、吞咽困难、声音嘶哑的情况，严重者甚至可因为生殖器疱疹的损害而堵塞气管，进而导致窒息而死亡，特别是婴幼儿生殖器疱疹中容易发生。