卵巢巧克力囊肿不能自愈。现在有巧克力囊肿的情况，不能治疗，如果现在囊肿比较小，可以服用药物进行治疗。是子宫内膜异位症的，就是进行性的痛经，可以药物或者手术治疗的。
卵巢巧克力囊肿是一种疾病，具体分析如下：
卵巢巧克力囊肿是因为子宫内膜异位在卵巢深处，经血无法及时排出，从而滞留在卵巢中，形成了一个囊肿，这种囊肿一般都是巧克力糊状，也就是所谓的卵巢巧克力囊肿。卵巢巧克力囊肿是由于子宫内膜异位所致，会出现痛经、月经紊乱等情况，甚至会出现不孕的情况。卵巢巧克力囊肿的治疗方法有两种，一是保守治疗，二是手术，如果病情不是特别严重，可以口服激素类药物。
大约有3%的巧克力囊肿会发生破裂。这有可能是因为外伤性或者是自发性而导致。这一现象的发生通常会因为巧克力囊肿的直径达到五厘米以上，才有可能导致破裂，而直径小于三厘米以下的巧克力囊肿，一般对女性朋友的身体是不会造成太大的伤害。
大多数情况下是术后半个月左右可以怀孕，但是具体还是要视身体的恢复情况而定。专家表示，巧克力囊肿术后试孕越早怀孕机会越大。因为巧克力囊肿的复发机会较高，并且随着时间的推移，妊娠的能力会逐渐下降，而术后是最容易怀孕的时期，妊娠的过程是对这个病的治疗，也许生完小孩后，此病就痊愈了。
以及治疗预后不一样，中医与西医见解不同，西医认为子宫内膜异位症属于雌激素依赖性疾病，治疗采取口服类雄性激素药，不同年龄不同生育要求治疗建议中医认为该病主要与痰瘀有关，痰浊阻遏经脉，影响冲任，致使经血不调，运行不畅，影响水液代谢，痰瘀是产生子宫内膜异位症症状和体征的关键。所以要慎重根据自身的状况来选择治疗。
有卵巢巧克力囊肿是一种妇科内分泌疾病，表现为月经周期不规律、不孕、多毛或痤疮，应该积极进行锻炼，多喝热水，减少高脂肪、高糖食物的摄取，降低体重，促使雄激素水平下降。
