医学认为感染是疾病的主要原因。肛周脓肿可由肛裂、痔疮、肛窦炎、肛周皮肤滤泡性汗腺炎、肛周皮肤病等感染引起。某些疾病，如溃疡性结肠炎、再生障碍性贫血、全身营养不良，使身体虚弱，降低抵抗力，并诱发肛周脓肿。一般也会见到因为肛门直肠手术引起的感染，从而形成直肠周围脓肿。尿道术后感染、尾骶骨骨髓炎术后感染、产后会阴破裂缝合后感染等手术都可能引起脓肿。
出现肛周脓肿的之后，是需要及时的进行对症治疗的，早期可以进行保守治疗。注意适当的使用溶液进行浸泡坐浴，适当的使用抗生素控制感染，促进恢复，若是情况比较严重、出现化脓的，需要进行排脓手术治疗。
肛门脓肿的治疗方法，患有肛周脓肿的及时就医正规的三甲医院，及时行手术治疗，尽早解除病痛，术后配合输液，换药治疗，加速愈合。术后注意饮食清淡忌辛辣，不要熬夜，多休息。
肛瘘多是肛门脓肿的后遗症，大多均有肛门脓肿病史或有肛门脓肿手术史，有的肛门脓肿自溃症状消失后自己觉得好了就不去医院就诊了。肛周脓肿术后形成肛瘘常用症状有，切口久不愈合，肛门脓肿手术切口久不愈合，有脓牲分泌物从切口溢出，局部有压痛。
肛周脓肿治疗一定要选择到正规的医院接受治疗。由于多数肛周脓肿是需要手术切开引流的，要注意一些肛周脓肿的治疗禁忌。微创肛周脓肿手术是借助先进的探针配合双氧水灌注的方法，准确找到全部内口，有效避免漏诊、漏治。平常要吃含纤维素多的食品，尽量的少吃辛辣刺激性的食物。
