引起先天性心脏病病因有内因和外因，内因主要与遗传有关，外因中主要与宫内感染有关。目前认为先天性心脏病的发生是胎儿周围环境因素与遗传因素相互作用的结果。在胎儿生长发育阶段，若有任何因素影响了心脏胚胎发育，使心脏某一部分发育停顿或异常，即可造成先天性心脏畸形。
是由于在发育过程中心脏出现停滞或者是有缺陷导致的，也可能与母亲在孕期中饮食中出现问题，或者是采用过药物相关，孕妇缺乏某些微量元素或基因缺陷，也会影响胎儿心脏的发育。
目前公认的因素包括母亲孕期感染，尤其风疹病毒感染，以及孕妇怀孕3到4月时不恰当的用药、感冒，是引起先天性心脏病的主要因素。其它因素包括遗传因素、环境因素。如接触不良放射线、环境污染等。
一般情况下，先天性心脏病可能会引起贫血，具体内容如下：
如果患者患有先天性心脏病，心脏通常存在发育异常的情况，这可能导致患者身体的血液循环受到影响，从而出现贫血的症状。因此，先天性心脏病有可能会导致患者出现贫血的情况。但是，并不是所有的贫血都是先天性心脏病造成的，营养不良等因素也可能导致患者出现贫血的症状。
可能和母亲在怀孕期间的健康和营养状况，母亲在怀孕的前三个月与病毒感染，如麻疹、腮腺炎、流感等，可能会影响胎儿心脏和大血管的生长，先天性心脏病的形成，或结合其他方面的畸形在同一时间。
先天性心脏病引起的智力低下，是不好治的。先天性心脏病的射血功能降低引起大脑供血不足，大脑的脑细胞功能受损，发育不好引起的。并非是心脏病导致的智力低下。二者均为染色体问题导致。
