功能性闭经的治疗方法有手术。
子宫性的病因有子宫内膜炎、子宫内膜损伤、子宫发育不全，建议可以通过子宫切除手术、宫腔内放疗等方式进行治疗。卵巢功能不正常引起的闭经，主要是因为性染色体异常，或者是单纯的卵巢发育不全。还有卵巢的功能肿瘤。引起闭经是因为垂体疾病引起的荷尔蒙水平的改变。因此，有闭经的症状一定要先检查一下病因。
子宫内膜损伤或粘连综合征常发生在人工流产后、产后出血或流产后出血刮宫以后，多是由于刮宫过度，损伤了子宫，造成宫腔粘连，出现闭经。宫内膜炎最常见的导致闭经的子宫内膜炎是结核性子宫内膜炎，其他流产后或产后严重的子宫内膜炎也可发生闭经。子宫发育不全或缺如由于副中肾管发育不全或不发育而致子宫发育不全或不发育，往往表现为原发性闭经。子宫切除后或子宫腔内放射治疗后因生殖道疾病切除子宫后或因某些子宫恶。
卵巢性闭经：卵巢功能失调所致的闭经多伴见阴道干涩，性交困难或不孕；卵巢早衰所致的闭经表现为40岁以前即闭经，伴面部潮热，烘热汗出，烦燥等更年期症状；多囊卵巢综合征之闭经可见肥胖，多毛，不孕。垂体性闭经：垂体肿瘤所致的闭经可伴有头痛，视物不清，或泌乳；垂体前时坏死之闭经，发生于产后大出血，表现为性欲减退，生殖器萎缩，乏力怕冷，毛发脱落。下丘脑性闭经：多发生于精神创伤，精神过度紧张，闭经为突然发生的。
流产后或产后严峻的子宫炎症会导致闭经，常见有结核性子宫炎症。由于刮宫过度，子宫受损伤，造成宫腔粘连，就会导致闭经。子宫内膜无法对卵巢做出正常的反应是称为子宫性闭经。若是在手术时因切除子宫或放射治疗而损害到子宫内膜均会出现闭经。
原因：子宫内膜损坏或子宫切除：如子宫内膜因受放射治疗破坏、刮宫过深或吸宫负压过高等，造成宫腔粘连所引起的闭经称Asherman氏综合征。严重感染如结核感染、产后或流产后感染等可损害子宫内膜。哺乳时间过长可使子宫内膜过度萎缩，甚至消失。闭经或者子宫切除对身体伤害不大。
