小便刺痛，但不是尿道口，而是根部，阴茎部有米粒大的...

尿道口流脓，小便刺痛通常是尿路感染。
尿路感染通常是细菌感染引起的。出现尿路感染之后，如果症状不太严重，可以多喝水，多排出尿液，冲刷尿路，缓解尿路感染导致的尿道口流脓，小便刺痛等症状。如果情况严重，可以在医生的指导下使用抗生素类用药物进行治疗。

考虑是尿路感染的，尿路感染是由细菌（极少数可由真菌、原虫、病毒）直接侵袭所引起，注意外阴的清洁卫生很重要。尿路感染多有一定的诱因，故应仔细检查有无尿路结石，肾或输尿管有无畸形等情况。除药物治疗外，多喝水，保持每天尿量在2000ml以上，这样起到尿路冲洗的作用，对于尿路感染的治疗也很重要。

小便刺痛可能是尿道炎，口服药物治疗即可，效果差时需要静脉输液治疗，反复发作就需要做一个尿常规检查，是否有上火或是尿道炎导致的可能，或者做尿的细菌培养，期间要多饮水，清淡饮食，忌辛辣刺激性食物，多喝水起到尿路冲洗的作用，保持局部的清洁和卫生。

可能是尿路感染，因为女性的尿道和阴道很近，女性的会阴部有大量的细菌附着，性交时通过阴茎的摩擦和阴道的挤压，可能导致细菌逆行进入尿道内，导致尿路出现感染。

小便出现刺痛，一般都由合并尿路感染引起，有尿路感染时会有尿频、尿急、尿痛的症状，尿频是小便的次数比较多。尿急是想尿时憋不住，急着上厕所。尿痛是排尿时可能会有刺痛。可以化验尿常规，看尿中有没有白细胞，有没有细菌。如果有白细胞、细菌，则支持尿路感染。女性尿路感染比较多见，因为女性尿路短，比较容易受到外界的因素影响，引起尿路感染。

龟头流脓一般多见于龟头炎等导致，可以到医院外科就诊检查，根据病情采取清创消毒治疗，然后选择消炎药治疗。另外可以做一下尿常规等检查，如果是细菌感染，可以使用药物类等消炎药治疗，注意多喝水，不要吃辛辣食物，暂停性生活，不要喝酒。