出现肛周脓肿的之后，是需要及时的进行对症治疗的，早期可以进行保守治疗。注意适当的使用溶液进行浸泡坐浴，适当的使用抗生素控制感染，促进恢复，若是情况比较严重、出现化脓的，需要进行排脓手术治疗。
肛门脓肿的治疗方法，患有肛周脓肿的及时就医正规的三甲医院，及时行手术治疗，尽早解除病痛，术后配合输液，换药治疗，加速愈合。术后注意饮食清淡忌辛辣，不要熬夜，多休息。
肛周脓肿治疗一定要选择到正规的医院接受治疗。由于多数肛周脓肿是需要手术切开引流的，要注意一些肛周脓肿的治疗禁忌。微创肛周脓肿手术是借助先进的探针配合双氧水灌注的方法，准确找到全部内口，有效避免漏诊、漏治。平常要吃含纤维素多的食品，尽量的少吃辛辣刺激性的食物。
医学认为感染是疾病的主要原因。肛周脓肿可由肛裂、痔疮、肛窦炎、肛周皮肤滤泡性汗腺炎、肛周皮肤病等感染引起。某些疾病，如溃疡性结肠炎、再生障碍性贫血、全身营养不良，使身体虚弱，降低抵抗力，并诱发肛周脓肿。一般也会见到因为肛门直肠手术引起的感染，从而形成直肠周围脓肿。尿道术后感染、尾骶骨骨髓炎术后感染、产后会阴破裂缝合后感染等手术都可能引起脓肿。
肛门脓肿严重。因为发病比较急，疼痛比较厉害，短时间内可以沿着肛周的脂肪间隙蔓延。如果是慢性的肛周脓肿，一般形成脓肿会有一个过程，疼痛不是特别厉害，全身症状不是特别重。
肛周脓肿迁延不治会形成肛瘘，肛周脓肿一定要及时到进行检查，对症治疗。肛周脓肿反复发作感染势必会引起肛瘘等肛周疾病，任由肛瘘发展，可对括约肌造成严重损伤，甚至可能造成肛门失禁等并发症。肛周脓肿形成早期，可采用抗感染治疗（包括针对需氧菌及厌氧菌的抗生素、中药清热解毒、疏泻通宣，通便、热水坐浴、理疗、休息等）。脓肿形成时，即应手术引流。
