胚胎停育的原因有生殖内分泌方面，因为胚胎早期的发育的时候需要三个重要的激素水平，雌激素、孕激素、绒毛膜促性腺激素，如果母体内源性激素不足就会造成胚胎的停育。二是生殖免疫问题，如果自身有某种抗体就会导致胚胎的发育。三是子宫的问题，如果子宫的内环境不好或者是畸形也不会发育。第四是染色体问题。
胎儿发育不良的原因有两种，一种是内在的，一种是外在的。
外在因素主要是受到外界的干扰，如电磁、环境等。此外，怀孕期间使用不当的药品，以及药品的刺激性也会导致胎儿的生长。女性体内的激素分泌不足，会造成胎儿缺乏养分，使胎儿不能充分的生长。另外，也可能是因为胎儿本身的染色体问题，从而造成胎儿的生长缺陷。精子和卵子的品质都会对胎儿的发育造成一定的影响，而优质的精子和卵子对胎儿的发育是非常有益的。
胚胎停育是指在孕十二周前胚胎在某些因素的影响下导致发育停止。大部分的胚胎停育是染色体问题导致的，男性精子活力差、畸形精子率高也可导致胚胎停育，子宫畸形也会引起胚胎发育不良。
怀孕胚胎停止发育有阴道流血、腰酸等症状。
如果妊娠期间胎儿停止生长，患者可能有阴道出血、腰酸、腹痛等情况。建议及时到医院就诊，确诊胚胎停止发育、稽留流产后，需要在流产之前进行必要的检查，并及时进行药物流产。如果患者胎儿排出后出现少量的出血，可以在三日内做B超检查，如果出血量大，则可以进行清宫，并且检测血HCG。
建议平时注意个人卫生，保持室内通风，避免剧烈运动和过度劳累，定期做产前检查，有利于身体健康。
胚胎或胎儿停止发育通常是胚胎染色体异常，还有母亲和父亲内分泌异常，再次还有环境因素，比如辐射、吸烟等，都会导致胎儿停止发育。确定是胎停育，要做流产，免得时间长引起感染。
造成胚胎发育异常的常见原因，有遗传、感染、免疫、接触放射性物质或有毒的化学制剂、孕妇禁忌的药物、高温、过度受刺激等。胚胎自身有缺陷或在发育过程中受不良因素影响停止了发育、一般无痛人流后子宫3个月就会恢复的，在人流后六个月以后再要小孩。
