肾积水较轻，病情进展缓慢，肾功能已达平衡和稳定状态可观察，但应定期检查了解积水进展情况。可自行解除的梗阻，如孕妇生理性肾积水。肾积水进行性加重，临床症状明显，肾功能不断下降，梗阻病因明确，有并发症存在，应手术治疗。
出现肾积水之后，应到做穿刺治疗，这样可以帮助更好的治疗，引发肾积水的期间，更应该注意做好消炎措施，这个期间还应该注意保持饮食的清淡，而且应该注意做好滋补养生的工作，这样可以防止造成病情加重，也可以防止造成其他影响。
肾积水的治疗大多数人不用治疗，可完全治愈。而由泌尿系感染引起的肾盂积水，多建议应用抗生素治疗，建议行中段尿微生物培养、泌尿系彩超、泌尿系CT等相关检查，治疗疗程一般为2周，为复杂性尿路感染。待感染控制稳定以后，肾积水也可以自行消失。如为梗阻引起的肾积水，明确是结石还是肿瘤压迫引起的，大多数解除梗阻后，肾积水可以消失。
去除肾积水的病因，保留患肾，如梗阻尚未引起严重的不可恢复的病变，在去除病因以后，往往会获得良好的效果。手术方法取决于病因的性质，例如先天性的肾盂输尿管连接部狭窄，可作肾盂成形术，肾、输尿管结石可行碎石或者取石术，这些手术近年来可用内腔镜，就是腹腔镜来进行，术后肾积水及肾功能就会有明显的改善。
肾积水治疗通常有保守治疗还有手术治疗。如果是肾积水比较轻，病情进展也比较缓慢，肾功能已经达到平衡稳定，可以注意定期复查，了解肾积水有没有进展。肾积水可以引起反复尿路感染，影响肾功能。
