囊肿本身是一种空腔性的病变，通常，外面有包膜，里面有液体，肿瘤的话，是一种实性占位性病变，二者之间有本质的区别，所以囊肿几乎不可能转变成肿瘤，大的囊肿也需要手术治疗。
肿瘤是机体组织细胞在内外有害因素的长期作用下，在基因水平上失去了对其生长的正常调控，发生过度增生及异常分化而形成的一种新生物。肿瘤的形成与营养因素、免疫因素、精神因素都有一定的关系。
主要来源于软骨、骨、骨髓、脉管、脂肪、脊索等部位。然而原发性骨髓的分类是根据肿瘤组织的形态区分的，主要就是根据细胞瘤的分化类型及生长的细胞间物质的类型区分的。
脑肿瘤目前病因不明确，一般普遍认为是因为环境因素和宿主因素等双重因素作用下形成的。在环境因素中，包括物理性的、化学性的和生物性的因素，比如已经明确的和脑肿瘤相关性的因素，包括离子射线与非离子射线、杀虫剂、亚硝胺化合物、致瘤病毒和其它感染性因素等。
良性的纵隔肿瘤是机体在各种致癌因素的作用下，基因发生突变，局部组织的某一个细胞在基因水平上失去对其正常生长的控制导致增生，而形成的新生物，多数认为跟环境污染，进食腌制或者烧烤食品，家族遗传、长期慢性炎症损害等因素有关。
