肛门癌早期的症状表现为肛门周围瘙痒和不适，或者局部有小肿块，还有便血，局部溃疡形成，伴有分泌物等。通过直肠指诊能触及肿块。还会出现黏液浓血便的症状，而且伴有疼痛。较大的肿瘤会影响肛门括约肌的功能，有的时候会出现肛门失禁。
肛门癌早期症状表现为肛门部位不适和瘙痒感，肛门边缘可见有小型肿块，初始时生长速度缓慢，疼痛较为轻微，当侵犯到肛管或者括约肌时则有明显的疼痛症状。病程进一步发展后，可以形成溃疡，局部出现分泌物，常混有血丝，溃疡底部有灰白色坏死组织，周边外翻可见颗粒状结节，质地脆容易出血。部分病人早期即可出现腹股沟淋巴结肿大，或者向盆腔淋巴结转移。
肛门癌的这种临床表现在初期的时候不是特别的明显，因为它常常可能与肛瘘、化脓性汗腺炎这些有相似的症状，但是在后期它就会表现会比较明显，它常常有肛门部位的不适感、瘙痒，肛门的边缘会有这种小型的肿物生长，它有这种缓慢性的疼痛，疼痛会比较轻微一些。
肛门癌的早期症状是大便带血，或者便前、便后的滴血，并且很容易和痔疮相混淆，因此当出现大便带血，或者便前、便后滴血，甚至大便中混有各种暗红色血液的时候，不要掉以轻心，一定要进行肛门指检。
外痔和的肛门癌区别是由于发生的解剖部位不同，按照齿状线来进行划分，另外内痔的血液回流入直肠下静脉，外痔的血液会流入肛管静脉。外痔的病人会表现为明显的疼痛，是体神经支配的区域。
大便习惯改变排粪次数增加，常伴里急后重或排便不尽感，粪便性状改变粪条变细或变形，常带有黏液或脓血，肛门疼痛是肛管癌主要特征，初时肛门不适，逐渐加重以致持续疼痛，便后更明显。
