有巧克力囊肿并不意味着无法怀孕。巧克力囊肿又称卵巢子宫内膜异位症囊肿，是引起痛经以及不孕不育的常见因素。如果是比较小的巧克力囊肿，临床症状不典型时可以先尝试怀孕，是有几率成功怀孕的。但是如果巧克力囊肿比较大，或者引起明显的痛经症状时，建议应该先进行手术治疗，同时在术后使用药物才能够提高术后的受孕概率。
巧克力囊肿手术后怀孕有可能会对胎儿带来影响，因此需要及时到医院进行检查。
巧克力囊肿手术以后会导致盆腔粘连，影响到输卵管，因此会影响到排卵功能，因此需要及时到医院进行检查，如果影响到胎儿健康，需要遵医嘱及时的终止妊娠，因此在做完手术后应该采取相对应的避孕措施。
在恢复期间可以多补充身体所需要的营养，而且还需要适当的进行锻炼。
巧克力囊肿的早期症状是痛经，且呈进行性加重，有的也可没有症状，是由于不孕症，去医院检查时才发现的。巧克力囊肿的症状主要是月经量多、痛经、腹部包块，尤其是会出现性前时疼痛出血。
会有影响。巧克力囊肿是卵巢子宫内膜异位症，卵巢是子宫内膜异位症比较常见的累及部位。子宫内膜异位症的典型表现就是继发性痛经并且渐进性加重，可以导致不孕症，比较大的囊肿需要手术治疗。
