牙周脓肿首先可以进行药物性的治疗，口服药物，而如果脓肿有波动感，需要先进行脓肿的切开，并且要在切开以后引流，先进行基础性的洗牙和龈下刮治，然后再进行牙周的手术治疗。
首先应该局部排脓引流，抗感染治疗，待脓肿消除后，治疗牙周炎，包括牙周基础治疗，牙周翻瓣治疗，如果已经出现牙髓病变，则需要进行牙髓的根管治疗。同时要保持好口腔卫生，正确使用牙线、牙间隙刷。
深层牙周袋内壁的化脓性炎症延伸至深层结缔组织，当脓液不能排入袋内时，袋壁软组织内会形成脓肿。深牙周袋是迂回的，涉及多个牙齿表面，不能顺利排出脓性渗出物，特别是涉及牙根分叉区域。在刮垢或刮擦过程中，作用是粗糙的，将碎屑和细菌推入牙周袋的深层组织或损坏牙龈组织。
牙周炎与口腔卫生不佳、牙结石过多有关，建议定期洗牙，清除牙结石，保持好口腔卫生，不吃辛辣刺激的食物，避免牙周炎反复发作。牙周脓肿，建议切开排脓，并口服抗炎药物对症治疗，如果牙齿松动明显，建议及早拔除换牙。
牙周脓肿的要避免食用太硬的食物，应该以绵软、清淡的饮食为主；牙周脓肿属于炎症，注意不要食用辛辣的食物，也不要抽烟喝酒；牙周脓肿需要及时到医院治疗，在医生的处理下，恢复的更快；饮食方面没有太大的禁忌。
