三个月宝宝睡觉老是摇头可能是缺钙、窒息缺氧病史等原因导致的。
1.缺钙：如果家长没有及时给三个月宝宝补充维生素D，可能会影响钙的吸收，容易导致缺钙，可能会引起神经兴奋性增高，导致睡眠不安，从而出现睡觉老是摇头的症状。
2.窒息缺氧病史：如果三个月宝宝出生的时候有窒息缺氧病，可能会影响正常的脑部功能，容易影响睡眠状态，从而出现睡觉老是摇头的症状。
一般情况下，宝宝三个月睡觉老是摇头可以是以下原因导致的：
宝宝三个月睡觉老是摇头，这就是维生素D和钙质的经典表现。缺乏维生素D和钙质的宝宝三个月会导致神经肌肉的兴奋，主要是由于汗腺的分泌增加，汗珠会刺激到头部，如果觉得痒，就会在枕头上来回的晃头，导致宝宝三个月睡觉老是摇头。还有就是睡眠浅、睡眠不安详，稍有一点声响就会惊醒，也会导致宝宝三个月睡觉老是摇头。
三个月的宝宝睡觉老是摇头一般是缺钙、湿疹、植物神经紊乱等原因导致的。
三个月的宝宝处于成长发育的重要阶段，如果平时进食不当可能会导致三个月宝宝缺钙，造成交感神经兴奋，引起三个月的宝宝睡觉老是摇头。三个月的宝宝身体新陈代谢比较快，可能脖颈部出汗较多，此时可能会导致湿疹，造成瘙痒，引起三个月的宝宝睡觉老是摇头。同时三个月的宝宝神经发育不成熟，可能会出现植物神经紊乱的情况，造成三个月的宝宝睡觉老是摇头。
一般情况下，三个月宝宝老是摇头可能是佝偻病、湿疹等原因引起的。
通常，三个月宝宝的新陈代谢比较旺盛，容易出汗，宝宝感觉不适后，就会出现老是摇头的情况。如果三个月宝宝患有佝偻病，早期会出较多的汗，宝宝觉得痒，也会出现老是摇头的情况；同时，如果宝宝头部比较湿润，接触刺激性的物质后，就可能引起湿疹，从而引起瘙痒，出现老是摇头的情况。因此，建议家长不要着急，及时到医院就诊，在平时可以给三个月宝宝适当地补充维生素D和钙剂，从而减少宝宝老是摇头的情况；注意平时不要捂宝宝，出现湿疹时在医生的指导下使用外用药膏进行治疗。
三个月的宝宝睡觉总是摇头蹬腿，最多见的就是缺钙，因为六个月以下的宝宝成长的比较快，尤其是前三个月成长得尤为快，这个时候就容易出现维生素D缺乏性佝偻病，表现为睡觉不安、容易哭闹、摇头、枕秃、出汗，睡不安稳的时候可能就会哭闹，就会四肢活动、挥舞四肢。
