疱疹性咽峡炎主要的症状是咽部疼痛、吞咽困难，有的会伴有高热的情况。在疱疹期间，如果出现持续发烧的情况，患者首先可以采用物理降温的办法，可以用温毛巾擦拭身体，同时也可以用冰袋冷敷额头、双侧颈部。在此期间患者一定要多喝水，必要的时候，退热药治疗。
疱疹性咽峡炎发烧需要四五天的，但是发烧多少天每一个人都不一样所以，该没有办法直接回答，但是一定要注意要尽快做一些退烧措施，不可以让身体持续的进行发热，这样很容易引起其方便的不适合，多吃一些蔬菜和水果这样有利于病情恢复。
可能是发生后体内缺水引起的刺激性咳嗽，疱疹性的咽峡炎也会出现咳嗽，只是咳嗽的症状并不是很严重，可以口服消炎药来治疗，如果出现白细胞的升高，说明合并细菌性的感染。
疱疹性咽峡炎早期有急剧发热，多为低度或中度发热，偶尔见温度高达40度以上，早期很少引起惊厥，热程大约是2-4天左右。年龄较大早期嗓子疼，疼痛严重可影响吞咽或者说话，这样的孩子早期都不喜欢吃东西，或者吃完东西之后可能咽不下去，又吐出来。
治疗小儿疱疹性咽峡炎，首先要应用抗病毒的药物对症治疗，根据病情的严重程度决定给药的途径，可以口服、局部雾化吸入和静脉滴入。一般此类疾病不应用抗生素，除非血常规检查白细胞和中性粒细胞增高，提示合并细菌感染，才应用抗菌素。同时要多饮水和流质饮食，补充患者的液体量。出现高热时要及时应用解热药物，避免引起高热惊厥。
疱疹性咽峡炎临床表现常有高热，体温达到40度以上，咽痛，软腭及颊粘膜处可见小的淡红色滤泡，局部破溃后，疼痛加重。一般多见于儿童，因为是病毒感染，有自愈性，急性期主要是控制体温，38.5度以下可以用温水擦拭手心，脚心。
