附睾炎按病程可分为急性附睾炎和慢性附睾炎两种。急性附睾炎多继发于尿道、前列腺或精囊感染，慢性附睾炎常由急性期治疗不彻底而引起。过早使用热疗可加重疼痛并有促进感染扩散的危险，所以早期宜用冰袋局部冷敷。性生活和体力劳动可加重感染，故应避免。
慢性附睾炎通常是由于急性附睾炎治疗不彻底所致。病变附睾发生纤维化，局部显得发硬，显微镜下可见附睾组织内疤痕形成，附睾小管闭塞，也有一定的淋巴细胞和浆细胞浸润。慢性附睾炎的临床表现并不严重，仅是隐痛不适。局部检查附睾呈硬块感觉，有轻度压痛与不适感，精索也略见增厚，输精管的直径有增粗现象。
慢性附睾炎的原因一般认为慢性附睾炎的致病菌是通过输精管腔逆行进入，亦有认为是通过淋巴系统入侵。临床呈慢性过程，附睾增大，质偏硬或伴有结节，压痛轻。由于附睾的解剖特点，附睾受感染后易发生肿胀、组织机化甚至结节形成。
附睾炎早期是一种蜂窝织炎，在输精管开始再延伸至附睾尾部。在急性期，附睾肿胀高低不平。感染从附睾尾延至附睾头。此时如切开附睾可见小脓肿，鞘膜分泌液可呈脓状。精索变厚，睾丸的肿胀是继发于被动充血，极少数病例睾丸同时发生炎症。早期组织学见水肿及中性白细胞、浆细胞及淋巴细胞浸润，以后即出现脓肿。感染在后期可完全消失而无损害，但附睾管周围的纤维化可使管腔阻塞。如为双侧附睾炎，可发生男性不育症。
一般得附睾炎的男性抵抗力会比较低，例如这段时间如果是男性的工作学习压力大、过度疲劳，经常熬夜或者是生活不规律等。当男性身体情况不好，抵抗力下降的时候，就容易让病原菌侵入身体，从而引发附睾炎。
急性附睾炎是由病原体感染所致，国外有研究认为，35岁以前的附睾炎多在性交后感染沙眼衣原体和淋球菌等病原体导致，而35岁以上的附睾炎则多由非性传播的革兰阴性肠道杆菌引起的尿道感染所致。
