贲门癌晚期症状不一样，如出现一些合并症，出血或穿孔，这是严重合并症，可能会短时间内导致患者去世。还有肿瘤导致的梗阻，导致进食困难，人会逐渐消瘦，营养消耗比较严重，最终出现多器官的功能衰竭，就是心肝肺肾功能慢慢衰竭。
贲门癌的主要症状是出血，可以引起黑便或者是呕血，另外可以导致疼痛症状，特别是出现在胸骨的后方，以及肩胛骨位置出现长时间的钝痛，除此之外，还影响到进食，导致吞咽困难，体重下降。
贲门肿瘤的早期症状为：出血：食管癌、贲门癌有时也会呕血或便血，贲门癌的肿瘤可浸润大血管而发生致命性大出血。疼痛：胸骨后或背部肩胛区持续性钝痛，表示贲门癌的癌外侵，引起食管周围纵隔炎，贲门癌引起的疼痛也可以发生在上腹部，应注意贲门癌的肿瘤有穿孔的可能。
出血；食管癌、贲门癌患者有时也会呕血或便血，贲门癌的肿瘤可浸润大血管而发生致命的大出血。这也是多见的患有贲门癌的临床表现。疼痛胸骨后或背部肩胛区持续性钝疼，表示贲门癌的癌外侵，引起食管周围纵隔炎，贲门癌的临床表现可引起的疼痛可以发生在上腹部，手术切除可能性小，要注意贲门癌的肿瘤有穿孔的可能。
随着肿块的进展，可导致贲门管腔狭窄，导致吞咽困难，胸骨后疼痛等。肿块长到一定程度，会导致肿瘤的坏死、溃疡，导致消化道出血，是上消化道出血的典型表现，有呕血、黑便等。由于进食困难和消化道出血，可导致患者营养障碍，表现为消瘦、贫血等。晚期病变可变为转移的症状，如肝肺的转移灶，锁骨上淋巴结肿大等。
