肾积水伴输尿管结石可以通过一般治疗、药物治疗、手术治疗来改善病情。
1、一般治疗：当出现肾积水合并输尿管结石时，患者可能会出现恶心呕吐、腰腹部疼痛、排尿困难、血尿等不适，在治疗的过程中要注意多喝水，适当的运动，一般有利于缓解梗阻的情况。
2、药物治疗：建议遵医嘱进行药物治疗，如使用枸橼酸氢钾钠颗粒、碳酸氢钠片等药物，可以碱化尿液，促进结石排出。如果出现了肾绞痛，一般要遵医嘱应用双氯芬酸钠缓释胶囊等非甾体类镇痛抗炎药物。
3、手术治疗：在保守治疗无效的情况下，可积极就医，采用体外冲击波碎石、经皮肾镜碎石术、输尿管镜碎石等方法进行治疗。
输尿管结石微创手术方法包括输尿管镜和经皮肾镜手术。输尿管镜手术，通过输尿管软镜技术将输尿管或肾中结石取出，不适用于较大的结石；经皮肾镜手术，从腰上肾的部位打一个小孔，直到结石部位，通过特殊的器械和方法，把结石打碎，从小孔取出。体外冲击波碎石，又称微波碎石或震波碎石，是较常用的方法，具有花费小、损伤小、恢复快和费用低等优点。
输尿管结石依据结石大小、部位及有无合并症治疗方式不一，结石＜0.6cm，没有合并症，可通过多喝水、多运动等排石治疗将结石排出，或是服用排石药物。结石较大，合并梗阻、感染，可行微创手术。微创手术损伤较小，出血较少，优于开放式手术。
可口服止痛药进行止痛，结石大，可以采用体外冲击波碎石，或留置输尿管支架解除梗阻，达到止痛效果。输尿管结石因导致尿液排出受阻，肾盂内压力突发增高，导致肾绞痛的发生。
有些可能是碎石之后，比较小的结石一两天就排完了。有些可能要十天，甚至半个月或者半个月以上，才可能排完石。当然也有一部分人存在输尿管狭窄的原因，即使碎了石，也不能完全排出。往往就需要进行手术，来辅助排石。
输尿管结石微创手术方法，在输尿管尿道口尿道进入膀胱，然后沿着输尿管口插入导尿管中，直至输尿管结石的位置，在输尿管镜的指使下沿着通道插入钬激光光纤或者气压弹道设备，将结石打碎取出。
