一般来说，念珠菌感染应当通过以下方式治疗。具体分析如下：
念珠菌是一种能感染口腔，食管，女性生殖系统，肺部的真菌。也有可能在血液中蔓延，导致血液循环，从而导致多种脏器的传染。易患有免疫力差、抗生素滥用或免疫抑制剂长时间服用者。治疗方法以抗菌药物为主。氟康唑、伊曲康唑、制霉菌素等都是治疗念珠菌病的常用药物。对于身体表面的感染性疾病，可以通过药物或者是物理疗法来进行。
需要注意的是，生活中定期清洗外阴，保持局部的清洁、干燥，出门在外，尽量不要使用宾馆的浴盆。
念珠菌感染首先要进行抗菌的治疗，可以在医生的指导下服用抗菌类的药物，记得在服药期间不要吃刺激性的食物，饮食上最好是吃的清淡一点，不要喝咖啡和浓茶以免会影响到药物的吸收，在平时的生活中要注意私处的卫生，每天早晚要清洗患处。
如果只是在显微镜下发现了阴道念珠菌菌丝，没有任何的不适反应，并不需要进行任何处理。一般情况下，可以通过外用药膏来进行调理，但由于念珠菌性阴道炎的病情不同，治疗方法也不尽相同。如病人为复杂的念珠菌感染，一般需用药物超过2个疗程。妊娠期间有念珠菌感染，可以使用少量的外用药物，这样会更保险一些。
女性复发型的阴道念珠菌感染一般一年发生4次或4次。
在临床上，念珠菌性阴道炎也被称作是假丝酵母菌病，可以采用以下方式进行治疗：
假丝酵母菌病是因为被假丝酵母菌所感染引起的，这是一种真菌性的疾病。通常会出现黄豆渣样的阴道分泌物增加。伴随着女性的外阴瘙痒，特别是在晚上和来例假的时候会更严重。可以用小苏达，把它变成清水来清洁阴道。也可以在阴道外涂上克霉唑或达克宁栓剂进行治疗。在药物使用过程中要避免同房。
西医治疗的基本原则是消炎杀菌，内外并治。珠菌性龟头炎可给予局部用肥皂水冲洗，然后涂抹外用软膏。治疗期间禁止性生活，每天更换烫洗暴晒内裤。需要夫妻同时治疗。生殖器念珠菌病绝大多数是一种条件致病性感染，除不洁性交引起本病的感染外，个体所患的某些疾病也是引起本病的原因。
念珠菌性阴道炎也称霉菌性阴道炎症。常表现为阴道瘙痒，白带呈豆腐渣样改变。因为念珠菌性阴道炎症容易反复发作。治疗上，必须按照疗程系统治疗。治疗期间严禁性生活，可以夫妻同治。
