益生菌是肠道中的一种必需的有益细菌，主要作用是改善腹泻、便秘，调节机体免疫力，防止过敏，益生菌在一定的程度上也起到抗肿瘤、治疗疾病的作用。益生菌还可以产生各种消化酶，并且能够缓解由于饮食不当或者有长期运用抗生素导致的菌群紊乱等。
治疗或者预防便秘或腹泻发生；增强人体的机体免疫力；促进营养物质吸收；防止泌尿生殖系统感染；降低胆固醇；预防骨质疏松；益生菌如果是含有乳杆菌，可以治疗乳糖不耐受症。
有助于提高免疫力，因为蛋白质向细胞输送各种营养为身体提供均衡的营养，为免疫系统制造对抗细菌和感染的抗体，调节机体机能，促进疲劳的恢复，增强人体免疫力；制造肌肉、血液、皮肤和各种身体器官，帮助身体制造新组织，以替代坏掉的组织；促进病后康复，帮助伤口血液凝结及聚合等。
一般情况下，益生菌有润肠通便、促进消化等作用与功效，具体内容如下：
1.润肠通便：益生菌广泛存在于患者的体内，有助于维系患者胃肠道的正常功能。而补充益生菌有助于促进患者胃肠道的蠕动，能起到润肠通便的作用，有助于促进大便排出。
2.促进消化：如果患者遵医嘱使用益生菌，通常能使各类菌群在患者体内达到一个平衡状态，从而促进患者消化，以改善腹痛、腹胀等消化不良症状。
益生菌可以改善免疫力，预防多种疾病。婴儿肠道系统可以占到免疫系统的2/3，所以说胃肠道当中正常菌群的建立就非常重要。益生菌可以促进消化，有效的避免了消化功能的紊乱和营养不良。特别对于拉肚子便秘，效果还是相当不错的。