霉菌素龟头炎的治疗方法主要以药物为主，但是选择具体的药物，要根据引起龟头炎感染的病原菌来选择。通常是细菌和真菌感染引起的，细菌性龟头炎，主要使用外用的抗生素。在治疗期间一定不能同房，而且勤换内裤，内裤使用开水烫洗之后，然后再放在太阳底下暴晒，这样才能够彻底杀灭真菌。
龟头炎多采用药物治疗，包括口服和外用抗菌药，如果病人合并包皮过长或包茎可以切除包皮。此外，病人应养成良好的卫生习惯，及时清洗包皮。如果是因为不洁性行为造成的龟头炎，应杜绝。
手术治疗大约需要1个月，非手术治疗半个月左右到20天左右，主要的原因是包皮过长和包茎，诱因主要是最近病人可能生活工作压力大，过度的劳累、进食刺激性食物和饮酒、吸烟过多导致的免疫力低下，也可以通过性接触而诱发。
龟头炎如果不是很严重，一般就是有一些红点或者红斑，或者包皮垢比较多，本身没有太明显的症状，可以先用清水注意清洗，不用专门用药，自己就可以好转，但是一般有大片的红斑，或者瘙痒症状，可以先外用抗真菌的抗生素外用。
如果病人的早期症状相对较轻，但只要做好日常保健的龟头炎本身可以好，如果龟头炎是更严重的病人，龟头炎想自己的好是不可能的事情，不治疗会导致疾病的继续恶化。在出现早期症状时，必须禁止性生活，每天用温水洗澡以清洁龟头，将龟头内的脏物清理干净。
