肩胛骨疼痛因为肩关节本身疾病，比如常见的肩峰撞击、肩峰下滑囊炎、肩袖损伤、关节盂唇损伤、肩关节不稳、钙化性肌腱炎等疾病，肩关节以外的骨科疾病，如颈椎间盘突出颈椎病、肩胛上神经卡压、胸廓出口综合征、肩胛提肌综合征，肩胛舌骨综合征等骨科疾病，内科内脏疾病，比如心绞痛、心肌梗死、肺梗死、肺癌、纵隔上下的疾病、胆囊炎、肝脏疾病等。都可引起肩胛骨疼痛。
由于肌肉韧带长时间的劳损或者受凉后导致的肌肉和韧带的痉挛或者无菌性的肌肉纤维炎引起的症状，软骨和肌肉间隙。通常由肌肉长时间保持一定时间引起。再发展就是肩周炎。可以平常多活动一下。不要坐很久。出汗会很有帮助。肩周炎是一种以肩痛和运动功能障碍为特征的常见疾病。
有可能是因为局部的肌筋膜炎导致的，局部的肌筋膜在受外伤，或者是受凉等一些炎症反应存在的情况下，会出现急性胃炎而出现疼痛。后背部的肩胛骨处的疼痛跟颈椎病有可能也有一定关系。颈椎病会导致肩部的疼痛，有可能肩胛骨处的肩胛提肌的疼痛是颈椎病引起的。左侧后背部的疼痛一定要注意，就是非特异性的心肌梗死，因为有一些后壁或者下壁的心肌梗死，表现出来的状态也是左侧肩背部的疼痛，从而会导致误诊的发生率。
这个部位出现疼痛，如果疼痛是慢性的，大多数是由于背部筋膜软组织炎症引起的问题，原因是着凉或长期弯腰工作造成的，以保守治疗为主，可以采取局部物理治疗和局部肌肉软组织松解方法治疗。
左侧肩胛骨内侧疼痛主要原因有菱形肌炎，肩胛提肌炎，棘上韧带炎等疾病，导致的肩胛骨内侧疼痛，疼痛的性质多为钝痛，酸痛。尤其在肩关节活动过多时，疼痛明显，这些疾病都是肌肉，起止点处的无菌性炎症。可通过保守治疗得到治疗，如局部热敷，按摩，肩关节的功能锻炼，外敷药物软膏，理疗等。
胸后肩胛骨疼痛考虑是由于劳损或者是局部组织的炎症引起来的，最常见的疾病就是背部的筋膜炎，由于过劳或者是长时间的姿势不正确造成。出现明显的疼痛，活动受限。另外，肝胆方面的疾病，如胆囊炎，胆结石后背也会呈现放射性疼痛。
